Ахмадеева Елена Ринатовна
Квалификационная работа магистра: "Анализ специфичности группы антител класса IgG по данным высокопроизводительного секвенирования библиотек генов."
Аннотация: На сегодняшний день, антитела составляют приблизительно одну треть от общего количества белков, используемых в терапии различных заболеваний в развитых странах. С их помощью можно проводить качественное и количественное определение содержания различных веществ методами иммуноферментного анализа и многих других. В настоящее время существуют эффективные методы получения рекомбинантных моноклональных антител к перспективным мишеням. Для создания антител к таким мишеням, необходимо индивидуально исследовать тот или иной способ их получения, а также отработать условия отбора наиболее аффинных представителей. В связи с быстрым развитием технологии секвенирования нового поколения и применения этой технологии при скрининге моноклональных антител, необходимо изучить способы обработки массива информации, полученного при секвенировании, для того что бы стали возможны новые пути скрининга высокоаффинных антител, которые в перспективе сократят количество in vitro экспериментов. Это позволит более эффективно находить новые биологические маркеры рака, аутоиммунных и многих других заболеваний.
В связи с актуальностью данной области исследования была определена цель представленной работы: увеличить эффективность процесса поиска моноклональных антител к перспективным мишеням (отбор моноклональных антител из библиотеки без in vitro экспериментов, основываясь на данных in silico анализа).
Для достижения поставленной цели были решены следующие задачи:
1) Создана библиотека фрагментов антител к определенному антигену;
2) Проведено высокопроизводительное секвенирование библиотек генов антител к антигену;
3) Разработан алгоритм обработки данных секвенирования библиотеки фрагментов антител;
4) Выбраны кандидаты аминокислотных последовательностей фрагментов антител на основе in silico анализа;
5) Созданы генетические конструкции scFv фрагментов антител против антигена для экспрессии в E. coli BL21 Gold;
6) Проведен иммунноферментный анализ фрагментов антител.
В результате данной работы был проведен скрининг in silico моноклональных антител библиотеки и полученные результаты были проверены in vitro.
Направление: Биология
Кафедра: Биохимии
Научный руководитель: к.б.н. Карабельский А.В., к.б.н. Леонова Л.Е
Отзыв научного руководителя
Рецензент: к.б.н. Тищенко Л.И.
Рецензия
Дата защиты: 15-06-2015
|
