Вихнина Мария Валентиновна
Квалификационная работа магистра: "Изучение роли транскрипционных факторов семейства NF1 в формировании структуры хроматина регуляторной области гена триптофандиоксигеназы крысы методом иммунопреципитации"
Аннотация: Изменение структуры хроматина, вызванное различными эпигенетическими процессами, играет существенную роль в регуляции процесса транскрипции. Среди таких эпигенетических процессов можно выделить формирование особой тканеспецифической структуры хроматина в регуляторных областях индуцибельных генов, хроматин которых ремоделирован таким образом, что сайты связывания транс-факторов в регуляторной области гена доступны для них ещё до сигнала к экспрессии. В реализации подобной структуры хроматина участвуют особые транскрипционные факторы, которые связываются со своими специфическими сайтами ещё до активации транскрипции и, тем самым, обеспечивают состояние компетенции или подготовленности гена к экспрессии. Предполагается, что к числу этой группы факторов относятся и белки семейства NF1 (nuclear factor 1). Для исследования роли белков семейства NF1 в поддержании компетентной к транскрипции структуры хроматина регуляторных областей гормон-зависимых генов в нашей группе изучается структура хроматина промоторной области гена тканеспецифического фермента триптофандиоксигеназы (tdo), экспрессия которого контролируется глюкокортикоидным гормоном. В частности, для гена tdo крысы, экспрессирующегося преимущественно в печени, было показано наличие в промоторной области трёх сайтов гиперчувствительности к ДНКазе I, что является показателем ремоделированного состояния хроматина данного регуляторного участка. Помимо этого, с помощью биоинформатического анализа последовательности промоторной области гена tdo было выявлено несколько сайтов взаимодействия с белками семейства NF1, совпадающих с сайтами гиперчувствительности к ДНКазе I. Принадлежность белков, связывающихся с регуляторной областью гена tdo, к семейству NF1 была подтверждена с помощью методов ретардации в геле и иммуноблоттинга. Все эти данные говорят о том, что структура хроматина промоторной области гена tdo компетентна к транскрипции, а в поддержании подобной структуры могут быть задействованы факторы семейства NF1.
Целью данной работы является исследование роли транскрипционных факторов семейства NF1 в формировании и поддержании тканеспецифической структуры хроматина регуляторной области гена триптофандиоксигеназы крысы. Основная задача работы заключается в проведении сравнительного количественного анализа с помощью ПЦР в реальном времени фрагментов хроматина, связанных с транскрипционными факторами семейства NF1, выделенных из печени (модель активной транскрипции) и почек крыс (модель репрессированной транскрипции).
Направление: Биология
Кафедра: Биохимии
Научный руководитель: к.б.н. Романовская Е.В.
Отзыв научного руководителя
Рецензент: к.б.н. И.М.Берлов
Рецензия
Дата защиты: 19-06-2015
|
