АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Жук Сергей Владимирович

Квалификационная работа магистра: "Эндотелиально-мезенхимный переход как модель в изучении роли гена Notch1 в развитии аорты человека"

Аннотация: Эндотелиально-мезенхимный переход клеток эндокарда является важным событием кардиогенеза позвоночных. В ходе этого процесса клетки эндокарда в атриовентрикулярном канале и выводящем тракте сердца приобретают способность к передвижению, разрушают базальную мембрану и мигрируют в интерстициальное вещество между эндокардом и миокардом. В результате формируются утолщения стенки сердца, из которых образуются клапаны. Было показано, что мутации в генах-компонентах каскада Notch связаны с рядом дефектов развития сердечно-сосудистой системы (Garg et al., 2005; High et al., 2007), затрагивающих клапан аорты и выводящий тракт. Целью данной работы являлось создание клеточной системы, позволяющей моделировать события ранних стадий кардиогенеза человека и изучать влияние гена Notch1 на способность клеток эндотелия человека претерпевать эпителиально-мезенхимный переход (ЭМП). В ходе работы индукция перехода осуществлялась несколькими способами: обработкой факторами TGFβ1 и PDGF-BB, лентивирусной трансдукцией внутриклеточного домена Notch1 (N1icd) и совместным культивированием с клетками, экспрессирующими лиганды Notch и EGFP. Оценка эффективности перехода осуществлялась при помощи иммуноцитохимической окраски клеток на эндотелиальные и мезенхимные маркеры. При сравнении клеток артериального и венозного происхождения было показано, что индукция перехода и приобретение мезенхимных маркеров в клетках аорты человека (HAEC) происходит при действии TGFβ1, в то время как клетки пуповинной вены (HUVEC) утрачивали эндотелиальные маркеры и приобретали мезенхимные при трансдукции активированным доменом гена Notch1. Для моделирования индуцированного лигандами белка Notch ЭМП эндотелиальные клетки вводили сообветсвующие гены (Dll1, Dll4 и Jag2) при помощи лентивирусных конструкций. Система совместного культивирования эндотелия и клеток с лигандами показала примерно одинаковую эффективность индукции ЭМП при иммуноцитохимическом анализе. Кроме того во всех популяциях клеток было показано увеличение экспрессии генов мишеней N1icd - HES1 и SLUG. Полученные данные позволяют утверждать, что клеточная система совместного культивирования является приемлемой для моделирования эндотелиально-мезенхимного перехода, происходящего в эндотелиальных клетках аорты.

Направление: Биология

Кафедра: Эмбриологии

Научный руководитель: Малашичева А. Б. , кандидат биологических наук

Дата защиты: 06-12-2011

Отзыв о магистранте: Сергей Владимирович работает в нашей лаборатории с момента поступления в магистратуру биолого-почвенного факультета, то есть примерно два с половиной года. За это время он проявил себя с очень хорошей стороны. Сергей пришёл в нашу лабораторию в момент её создания и переезда в новое помещение, с чем он стоически справился. Он принимал активное участие не только в научной работе, но и в бытовом обустройстве, за что лаборатория ему очень благодарна. Сергей трудолюбивый и увлечённый студент, особенно когда это касается овладения методиками – у него просто «золотые руки», что нечасто встретишь у студентов. За время работы ему пришлось освоить множество разнообразных современных и классических методов работы – от культивирования линий клеток и получения первичного материала до количественной ПЦР и самостоятельной работы с секвенатором. Многие методики были освоены и налажены Сергеем самостоятельно, и другие сотрудники лаборатории перенимали их у него, что указывает на его несомненный методический талант. Работа Сергея была чисто поисковой, и рискованной с точки зрения выполнимости, и кроме того она была совершенно новой не только для него, но и для научного руководителя. Сергея не испугали все эти трудности, и он активно работал на протяжении всего обучения в магистратуре. За время обучения нам удалось два раза командировать Сергея на стажировку в Германию для овладения новыми методами и подходами, где он также проявил себя очень хорошо, работая в проекте немецкой лаборатории и одновременно выполняя работу по своему собственному магистерскому проекту. Подчеркну, тем не менее, что подавляющее большинство результатов получены Сергеем в нашей, российской лаборатории. Кроме того, необходимо упомянуть, что далеко не все полученные результаты вошли в ВКР, так как Сергей участвовал ещё во многих других экспериментах, и как результат будет включён соавтором в ряд статей, которые мы сейчас готовим к публикации. Как у любого студента, у Сергея, конечно, были периоды, когда эффективность работы падала – я связываю это и с трудностью проекта, и с высокой самокритичностью Сергея. Однако он успешно справился с этими периодами и смог сосредоточиться для успешного завершения магистерской выпускной работы. В целом я как руководитель оцениваю работу Сергея Жука на «отлично», очень ценю то, что он сделал для лаборатории и проекта, в котором мы работали вместе, и надеюсь на дальнейшее сотрудничество. Также я искренне желаю Сергею больше верить в свои силы, не терять свои рабочие навыки, совершенствоваться в планировании экспериментов и обдумывании результатов и, конечно, стремиться к новым научным высотам.

Рецензент: Дмитриева Р. И., кандидат биологических наук

Рецензия: Выпускная магистерская диссертация, автором которой является Сергей Владимирович Жук, посвящена разработке клеточных моделей, позволяющих изучать ранние события кардиогенеза человека и роль гена Notch1 в регуляции эндотелиально-мезенхимного перехода и развитии аорты человека. Работа представляет собой интересное, самостоятельное исследование; автором проведен тщательный и полный обзор и анализ литературных источников, который ясно и интересно написан; спектр методов исследования широк и полностью соответствует поставленной перед автором задаче. Хочу сразу подчеркнуть, что задача перед Сергеем Владимировичем была поставлена сложная: создать адекватную клеточную модель для исследования in vitro механизма биологического процесса всегда непросто, все модели будут иметь свои ограничения и всегда приходится решать, какими свойствами модели можно пожертвовать в данной ситуации, а за какие параметры следует бороться. Необходимость использовать первичный человеческий материал эту задачу существенно усложняет. Поэтому, при создании модельных систем всегда приходится тестировать различные методические подходы, и быть готовым к тому, что не все экспериментальные подходы, описанные в литературе, будут работать в ваших моделях и что некоторые пути в конце концов приведут в тупик. Сергей Владимирович весь этот сложный путь успешно преодолел. Сразу бросается в глаза, что представленный материал отражает огромный объем выполненной экспериментальной работы: отработаны методы получения эндотелиальных клеток из разных тканей человека, исследованы особенности различных механизмов индукции ЭМП в разных типах эндотелиальных клеток, выбраны наиболее надежные молекулярные маркеры перехода, созданы лентивирусные частицы для трансдукции клеток эндотелия генами, кодирующими лиганды сигнального пути Notch. В результате, разработана клеточная система для изучения механизмов ЭМП и его роли в процессах, происходящих как на ранних этапах развития аорты человека, так и при патогенезе сердечно-сосудистых заболеваний. Безусловно, недостатки у этой работы есть. Я не буду перечислять ошибки, опечатки и неудачные обороты. Их хватает. Также, не всегда удачно оформлены иллюстрации: не подписаны оси ординат на диаграммах; на фотографиях, иллюстрирующих результаты иммуногистохимического анализа, хотелось бы видеть подписи, указывающие, экспрессия какого белка исследовалась; в тексте, при обсуждении результатов не везде даны ссылки на соответствующие рисунки; немножко «скомкано» обсуждение. Все приведённые замечания никак не повлияли на мой главный вывод: рецензируемая работа удовлетворяет всем требованиям, предъявляемым к ВКР магистра и заслуживает отличной оценки. Данную работу предлагаю отметить и рекомендовать к публикации. В заключение, я бы хотела задать Сергею Владимировичу вопрос. Очевидно, что этот проект не может прекратиться после защиты Вашей диссертации; наоборот, поскольку в лаборатории появилась клеточная модель ЭПК, следующим этапом проекта должны стать функциональные исследования с использованием разработанной модели. Мой вопрос я бы сформулировала так: какие функциональные исследования с применением этой модели Вы бы рекомендовали/хотели провести в первую очередь?

Оценка: 5

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017