АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Титов Вячеслав Сергеевич

Квалификационная работа магистра: "Генетическое картирование симбиотических генов гороха посевного (Pisum sativum L.)"

Аннотация: Появление способности корневой системы к установлению обоюдно полезных (мутуалистических) симбиотических взаимоотношений с микроорганизмами обусловило стратегию наземного образа жизни растений. Наиболее распространенными типами таких растительно-микробных взаимодействий являются эндосимбиозы - арбускулярная микориза и бобово-ризобиальный симбиоз. Одним из главных преимуществ бобовых растений, по сравнению с остальными сельскохозяйственно-ценными культурами, является возможность формирования обоих видов сообществ, формирование которых благотворно влияет на растение, увеличивая его продуктивность, улучшая качественный состав семян, повышая устойчивость растений к патогенам. Именно по этой причине бобовые растения являются наиболее подходящей моделью для изучения процессов развития и функционирования взаимовыгодных симбиозов растений и микроорганизмов. В настоящее время ведётся интенсивное изучение генов, участвующих в развитии и функционировании симбиозов бобовых растений с арбускулярно-микоризными грибами и клубеньковыми азотфиксирующими бактериями. Горох посевной, как модельный объект так же является одним из наиболее ценных в сельском хозяйстве видов бобовых растений, поэтому определение функций симбиотических генов гороха имеет как фундаментальное, так и практическое значения. На данный момент идентифицированы более 40 симбиотических генов гороха (Sym-генов). Так как изучение последовательностей и функций генов невозможно без предварительной их локализации, первым этапом изучения является картирование генов на генетической карте гороха посевного. В ходе выполнения работы было произведено картирование генов Sym32, Sym36 и Crt относительно ген-специфичных молекулярных маркеров, созданных на основе первичных последовательностей модельного бобового диплоидной люцерны (Medicago truncatula Gaertn.). По результатам картирования гена Sym36 относительно 7 ген-специфичных молекулярных маркеров было выявлено, что последний локализуется в верхней части VI группе сцепления гороха посевного. Так же было произведено картирование гена Sym32 относительно 12 ген-специфичных молекулярных маркеров, однако сцепления с анализируемыми маркерами выявлено не было. Дальнейшее картирование относительно другого набора маркеров позволит локализовать ген Sym32 на генетической карте гороха. В ходе картирования было показано, что ген Crt локализуется в верхней части V группы сцепления гороха посевного. В данном регионе было выявлено три гена кандидата, дальнейшее секвенирование которых позволит подтвердить или опровергнуть соответствие одного из них гену Crt.

Направление: Биология

Кафедра: Генетики и Селекции

Научный руководитель: Жуков В. А. , кандидат биологических наук

Дата защиты: 13-06-2012

Отзыв о магистранте: Титов Вячеслав Сергеевич начал выполнять научно-исследовательскую работу в лаборатории генетики растительно-микробных взаимодействий ВНИИ сельскохозяйственной микробиологии с 2007 года, будучи студентом второго курса биолого-почвенного факультета Санкт-Петербургского Государственного Университета. С первых дней работы в лаборатории В.С. Титов проявил себя как увлеченный и ответственный работник, успешно справляющийся с поставленными задачами. Областью научных интересов В.С. Титова является изучение генетической системы гороха посевного, контролирующей развитие растения и образование мутуалистических симбиозов с почвенными микроорганизмами. По результатам исследований в 2010 г. В.С. Титовым была успешно защищена ВКР бакалавра. Магистерская диссертация В.С. Титова по теме «Генетическое картирование симбиотических генов гороха посевного (Pisum sativum L.)» является продолжением бакалаврской работы и посвящена генетической локализации генов гороха Crt, Sym32 и Sym36. При непосредственном участии В.С. Титова разработана серия ген-специфичных молекулярных маркеров, которые были использованы в картировании генов гороха. Проведена точная генетическая локализация гена Crt, контролирующего морфогенез корневых структур, относительно молекулярных маркеров, созданных на основе генов гомологичного района генома люцерны. На основании точного картирования гена Crt выбрано 5 генов-кандидатов, один из них (CCS2) является наиболее вероятным наиболее вероятным кандидатом на роль ортолога искомого гена гороха. В результате работы по картированию гена Sym32, контролирующего дифференцировку бактероидов, не удалось выявить сцепления с использованными маркерами, тем не менее, удалось сузить район вероятной локализации данного гена. Ген Sym36, вовлеченный в формирование симбиотических компартментов, локализован в VI группе сцепления относительно трех маркеров. В процессе выполнения исследования Титов В.С. приобрел навыки работы с растительным и микробиологическим материалом, освоил современные методы молекулярной биологии, включая методы работы с компьютерными базами данных и анализа нуклеотидных и белковых последовательностей. Результаты научного исследования Титова В.С., в том числе представленные в магистерской диссертации, были доложены на международных и российских научных конференциях. Титов В.С. принимает активное участие в серии национальных и международных научно-исследовательских программ, в том числе в научно-исследовательских проектах, поддержанных Российским фондом фундаментальных исследований и Министерством образования и науки РФ. Вячеслав Сергеевич выполняет общественную работу в лаборатории и поддерживает хорошие отношения с ее коллективом. Таким образом, Титов В.С. является высококвалифицированным, увлеченным и ответственным молодым специалистом, работающим на современном научном уровне.

Рецензент: Додуева И. Е., кандидат биологических наук

Рецензия: Магистерская диссертация Титова В.С. представляет собой законченное исследование по актуальной проблеме изучения генетики азотфиксирующего симбиоза, конкретной темой исследования является картирование трех симбиотических генов гороха. Работа выполнена на 69 страницах и включает в себя традиционные разделы: обзор литературы, материал и методы, результаты и обсуждение, заключение, выводы, список использованной литературы. Название работы «Генетическое картирование симбиотических генов гороха посевного (Pisum sativum L.)» полностью отражает суть проведенных автором исследований. В кратком, но информативном введении автор вводит читателя в курс дела и формулирует цель и задачи исследования. К этому разделу имеется небольшое замечание: на стр. 3 автор пишет «Горох посевной является первым объектом генетики, с использованием которого Грегором Менделем, Гуго де Фризом, Карлом Коренсом и Эрихом Чермаком были сформулированы и проверены одни из главных законов генетики». Поскольку из троих переоткрывателей законов Менделя только один (Чермак) сделал свои исследования, как и Мендель, на горохе, автору следует быть более аккуратным со ссылками на великих людей. В обзоре литературы рассмотрены современные данные о генетическом контроле развития мутуалистических эндосимбиозов у бобовых: азотфксирующего симбиоза с ризобиями и арбускулярной микоризы, а также описаны принципы построения генетических карт геномов бобовых растений, в частности – объекта исследований (гороха посевного). Обзор очень информативный и вместе с тем написан очень четко и «по делу», т.е. не содержит ничего лишнего, напрямую не относящегося к теме исследования. Обзор отлично проиллюстрирован (содержит 13 рисунков), что облегчает восприятие информации. Важно, что на первых страницах работы автор приводит список использованных сокращений, который облегчает восприятие информации обзора, т.к. текст работы изобилует аббревиатурами. Тем не менее, в этом разделе имеются некоторые мелкие недочеты: На стр. 12 автор пишет: «Другой тип клубеньков, детерминированный, …, обнаруживается у бобовых растений подсемейства Papilinoidea»; через несколько строк: «Предполагается, что бобовые подсемейства Papilinoidea, формирующие недетерминированные клубеньки». Непонятно, какой все же тип клубеньков характерен для представителей подсемейства Papilinoidea - детерминированный или недетерминированный? На стр. 34 автором используются термины «интерзона II-III», «истинная зона III», имеющие отношение к структуре клубенька; эти термины нигде более в обзоре не встречаются и никак не разъяснены. Неспециалисту остается только догадываться о расположении и назначении этих зон. Некоторые аббревиатуры не расшифрованы в тексте и не внесены в список сокращений: на стр. 15, рис. 5 - БРС (вероятно - Бобово-ризобиальный симбиоз?); на стр. 24 – типы ген-специфичных молекулярных маркеров (RFLP, AFLP, RAPD, SCAR). Стр. 33, рис. 12: не дана ссылка на работу, из которой взят рисунок; две фотографии, включенные в рисунок, обозначены почему-то D (первая) и b (вторая). Стр. 34, подпись к рис. 13: рисунок называется «Структурная организация клубеньков мутантов RisFixL и RisFixO». Вместе с тем, обозначения RisFixL и RisFixO нигде в обзоре не фигурируют, что затрудняет для неспециалиста понимание представленного таким образом иллюстративного материала. Следует отметить, что обозначение RisFixO объясняется в работе чуть позже, в разделе «Материалы и методы», но RisFixL не расшифровано вообще нигде. В разделе «Материалы и методы» автор описывает использованные им в работе нормальные и мутантные линии гороха, а также методы исследований. Достоинством раздела является подробное описание методов, делающее возможным использование их другими студентами. К недочетам данного раздела относятся: Серьезная опечатка в описании одной из мутантных линий. На стр. 35 автор пишет: «линия, несущая мутацию в гене Sym36: RisFixO, полученная на родительской линии Finale», далее из текста становится понятно, что sym36 – это RisNod24, а строка «RisFixO, полученная на родительской линии Finale» скопирована из описания линии, несущей мутацию в гене Sym32. Опечатка на стр. 37-38: условия ПЦР перечислены 2 раза. Использование в описании методов не совсем научного термина «носик» (вероятно, наконечник для пипетки) (стр. 36 и 40). В разделе «Результаты и обсуждение» подробно описан ход работы по картированию симбиотических генов гороха Crt, Sym32 и Sym 36, а также полученные автором результаты. Автором успешно проведено картирование гена Crt, с помощью ген-специфичных молекулярных маркеров, выбран наиболее вероятный ген-кандидат – ССS2, демонстрирующий полное сцепление с Crt. Таким образом, автору осталось сделать только один шаг до определения природы мутации Crt. Картирование генов Sym32 и Sym 36 оказалось чуть менее успешным, тем не менее, ген Sym36 был картирован автором в VI группе сцепления гороха посевного, а для Sym32 удалось исключить из зоны поиска участки, перекрываемые использованными в работе маркерами. Раздел «Результаты и обсуждение» дает представление о большом объеме и несомненной успешности проделанной автором работы. Раздел замечательно проиллюстрирован (содержит 7 рисунков и 6 таблиц). К разделу имеется один вопрос по поводу табл. 5 на стр. 44. Судя по таблице, функция гена CCS3 неизвестна, тем не менее, имеется информация о том, что он содержит мотив F-BOX. Насчет гена CCS4 сказано, что он, возможно, обеспечивает работу протеасомного комплекса, но никакой информации по его структуре нет. Вопрос: нет ли здесь путаницы (переставленные строки в таблице)? Просто мотив F-BOX характерен для некоторых белков, обеспечивающих работу протеасомного комплекса (для убиквитин-лигаз). Может, именно эта функция предполагается для F-BOX-содержащего CCS3, а для белка CCS4 с неизвестной доменной структурой ничего неизвестно и про функцию? К небольшим недочетам раздела относятся «съехавшие» подписи к некоторым рисункам и таблицам (рисунок или таблица на одной странице, подпись к нему – на другой, что несколько затрудняет восприятие иллюстративного материала). В разделе «Заключение» автор дает краткое перечисление полученных им результатов, а также описание работы, которую предполагается проделать для успешного достижения планов по окончательному картированию Sym32 и Sym 36. В конце работы автор делает 3 вывода, полностью отражающие результаты работы. К заключению и выводам у рецензента замечаний нет. Список литературы включает в себя 130 источников. Рецензентом найдено несколько несоответствий между цитируемыми в работе источниками и списком литературы (нет ссылок на некоторые источники). Несомненным достоинством работы является обширная благодарность, которую автор выражает своему руководителю, коллегам, зав. лаборатории, родным и близким. Благодарность занимает целую страницу текста, что, несомненно, положительно характеризует человеческие качества автора. В целом магистерская диссертация Титова Вячеслава Сергеевича «Генетическое картирование симбиотических генов гороха посевного (Pisum sativum L.)» производит очень благоприятное впечатление. Автор проделал очень большую работу и получил интересные результаты. Отмеченные рецензентом мелкие недочеты никак не влияют на качество работы – в конце концов, без опечаток и неточностей не обходится практически ни одна ВКР. Магистерская диссертация Титова Вячеслава Сергеевича, несомненно, заслуживает оценки «отлично».

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017