АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Абышева Светлана Николаевна

Квалификационная работа магистра: "BLM – новый ген, ассоциированный с наследственым раком молочной железы"

Аннотация: Наследственные факторы риска вносят существенный вклад в развитие рака молочной железы (РМЖ). Однако мутации в известных РМЖ-ассоциированных генах BRCA1 и BRCA2 обнаруживаются только в 15-20% семейных случаев этой патологии. Для поиска новых генов, связанных с развитием наследственного рака молочной железы, мы проанализировали полные кодирующие последовательности генов BLM, BRD7, DDB2, ERCC1, FANCG, PARP1, PARP2, RNF8, WRN в коллекции из 95 «генетически-обогащенных» случаев РМЖ. В результате было обнаружено 2 случая гетерозиготного носительства мутации в гене BLM (с.1642С>T, p.Q548X). Ген BLM относится к семейству RecQ-геликаз и участвует в поддержании стабильности генома. Гомозиготные мутации в гене BLM являются причиной развития редкого аутосомно-рецессивного заболевания – синдрома Блума. Верификация роли мутации BLM Q548X в развитии наследственного РМЖ была осуществлена в традиционном молекулярно-эпидемиологическом исследовании «случай – контроль». Частота указанного повреждения в группе РМЖ составила 17/1498 (1.1%), а в группе здоровых женщин – 2/1093 (0.2%) (p=0.005). Более того, частота мутации была выше у пациенток с отягощенным семейным анамнезом (6/251 (2.4%) vs. 11/1247 (0.9%), p = 0.04), ранним началом заболевания (12/762 (1.6%) vs. 5/736 (0.7%), p = 0.10) и билатеральным поражением (2/122 (1.6%) vs. 15/1376 (1.1%), p = 0.58). Отношение рисков (OR) составило 6.3 (95% CI: 1.8 – 39.5). Опухоли от носительниц мутации Q548X были подвергнуты молекулярному и иммуногистохимическому анализу. Так, ни в одной из опухолей не было обнаружено потери гетерозиготности гена BLM, а также мутации в повторе (A)9 7 экзона. Экспрессия рецепторов эстрогенов и прогестерона была обнаружена в 13/18 (72%) карциномах; в большинстве опухолей отсутствовала экспрессия базальных маркеров и онкогена HER2/neu, что позволило отнести их к люминальному А подтипу. В отношении степени злокачественности никаких особенностей, характерных для BLM-ассоциированных карцином, выявлено не было. Таким образом, результатом данного исследования стала идентификация новой мутации в гене BLM у пациенток с наследственной формой РМЖ.

Направление: Биология

Кафедра: Цитологии и Гистологии

Научный руководитель: Иевлева А. Г. , кандидат медицинских наук

Дата защиты: 16-06-2012

Отзыв о магистранте: Абышева Светлана Николаевна занимается научной работой на базе лаборатории молекулярной онкологии НИИ онкологии им. Н.Н. Петрова с осени 2008 года. За время работы ею были освоены основные процедуры молекулярно-генетического анализа, а именно, выделение и очистка нуклеиновых кислот, полимеразная цепная реакция (как в обычном формате, так и в режиме реального времени) и ее различные модификации (аллель-специфическая ПЦР, мультиплексная ПЦР, анализ кривых плавления с высоким разрешением (HRMA)), рестрикционный анализ, метод электрофоретического разделения нуклеиновых кислот, секвенирование. Кроме того, студентка познакомилась с методикой проведения иммуногистохимического исследования в лаборатории патоморфологии института. В 2010 году С.Н. Абышева защитила выпускную квалификационную работу бакалавра, выполненную на базе нашей лаборатории. Исследованиями, которые легли в основу магистерской диссертации, Светлана Николаевна начала заниматься летом 2010 года. Работа студентки посвящена актуальной на сегодняшний день проблеме – изучению генов наследственной предрасположенности к раку молочной железы. Результаты данных исследований способствуют пониманию фундаментальных основ канцерогенеза. Кроме того, такие работы лежат в основе создания диагностических тестов, направленных на раннее выявление онкологического заболевания. В экспериментальной работе и при обработке результатов С.Н. Абышева продемонстрировала большую самостоятельность и способность быстро освоить как методические приемы, так и необходимые компьютерные программы. Должна отметить высокий уровень знаний, полученных Светланой Николаевной в Государственном университете, и ее способность применить их для решения конкретной задачи, использовать при обсуждении полученных ей результатов. С сентября 2009 года С.Н. Абышева является сотрудником лаборатории молекулярной онкологии. Основным направлением научной деятельности студентки является изучение молекулярных аспектов канцерогенеза и предрасположенности к развитию злокачественных новообразований. Аккуратность, исполнительность, научная эрудиция и умение работать в коллективе позволили Светлане Николаевне добиться хороших результатов. Студентка имеет многочисленные публикации в отечественных и зарубежных научных изданиях. Помимо исследовательской работы, Светлана Николаевна принимает активное участие в общественной деятельности лаборатории. В частности, незаменимой оказалась помощь Светланы в подготовке ежегодной конференции по фундаментальной онкологии «Петровские чтения». Более того, студентка участвует в проекте по созданию Международной базы данных соматических мутаций человека SciOnco. Светлана пользуется доверием и заслуженным уважение коллег. Считаю, что магистерская диссертация Абышевой Светланы Николаевны «BLM – новый ген, ассоциированный с наследственным раком молочной железы» заслуживает оценки «отлично».

Рецензент: Спивак И. М., кандидат биологических наук

Рецензия: Работа, представленная Светланой Николаевной Абышевой посвящена важной современной теме - поиску новых генов, ассоциированных с наследственным раком молочной железы. На данный момент принято считать, что до 20% всех случаев рака молочной железы возникают как результат реализации генетической предрасположенности. При этом мутации в уже известных генах могут объяснить только около 25% наследственных случаев заболевания. Несмотря на все прилагаемые усилия, эффективное лечение рака молочной железы по-прежнему возможно только при его обнаружении на ранних стадиях и в медицинском сообществе распространено представление о неизлечимости инвазивной формы этого заболевания. Поэтому проблема создания современных диагностических подходов для раннего выявления рака молочной железы стоит перед молекулярной онкологией как никогда остро. Поиск путей предсказания высокой вероятности возникновения заболевания – то есть генов, мутации которых приводят к возникновению ракового синдрома - одно из направлений, позволяющих приблизиться к решению этой проблемы. Таким образом, актуальность работы С.Н.Абышевой не вызывает сомнений. Поставив своей целью нахождение новых мутаций, приводящих к повышенному риску развития рака молочной железы С.Н.Абышева пришла к необходимости предварительного отбора генов-кандидатов. В результате литературного анализа и подробного обсуждения полученных ранее результатов, была предпринята работа, позволившая секвенировать те гены, которые интересовали Светлану Николаевну в также тщательно отобранной группе пациенток. Сложную методическую проблему, стоящую перед ней, С.Н.Абышева разделила на несколько этапов и таким образом четко сформулировала задачи исследования. Диссертационное магистерское исследование С.Н.Абышевой построено вполне традиционно и содержит все обычные разделы. Литературный обзор написан очень подробно и достаточно ясно, опирается на 161 цитируемую работу, причем многие работы – совсем свежие, 2009-2011 годов. Очень важно, что в литературном обзоре присутствует подробное описание гистологических типов опухоли молочной железы, которое выпускница кафедры цитологии и гистологии С.Н.Абышева делает грамотно и последовательно. Огромный объем материала, накопленный (и постоянно появляющийся) в области экспериментальной онкологии достаточно трудно полностью охватить и систематизировать, но С.Н.Абышева с несомненным успехом выбирает важные для ее исследования работы и сознательно ограничивает обзор литературы описанием этиологии, морфологии и эпидемиологии рака молочной железы и роли в развитии заболевания мутаций и полиморфизма различных генов как с высокой, так и со средней пенетрантностью. Обзор литературы – несомненное достижение данной магистерской работы. Иногда в описания вкрадываются опечатки, стилистические погрешности или неточности: например в табл.1 на стр. 18-19 АТМ названа сенсором однонитевых разрывов, но она, в первую очередь, сенсор двунитевых разрывов ДНК, у синдрома Ниймеген – более принятое название Ниймегенский синдром ломкости хромосом, а PARP называется «Хроматин ассоциированная поли(АДФрибозил)трансфераза», хотя более принятое название - поли-АДФ-рибоза-полимераза или полимераза поли-АДФ –рибозы. К тому же часто (стр. 16, 21. 44) фамилия автора цитируемой статьи пишется в русском тексте по-английски, что обычно не принято. Работа выполнена на высоком методическом уровне, причем выбор методов был продиктован самой постановкой задач. Полногеномные ассоциативные исследования (Genome Wide Association Study, GWAS) не позволяют выявить редкие патогенные мутации, ассоциированные с заболеванием. Зато они могут быть определены с помощью других подходов, таких как анализ сцепления, секвенирование кандидатных генов и полно-геномное секвенирование. Поэтому Светлана Николаевна построила свое исследование на целом ряде сложных современных молекулярно-биологических и цитологических методов: выделение ДНК различными способами, RT-PCR, секвенирование, а также приготовление и анализ гистологических препаратов с применением иммуногистохимии. Особенно интересно было описание отбора группы пациенток для генетического анализа и дальнейшего сравнения. Сам отбор генов-кандидатов из числа генов, вовлеченных в процессы репарации ДНК, выглядит теоретически обоснованным и очень убедительным. Все это изложено в разделе «Материалы и методы", написанном грамотно и подробно. Уже само перечисление праймеров, использованных для ПЦР-анализа всей кодирующей части 9 генов-кандидатов занимает 11 страниц! Результаты работы занимают серьезную часть магистерской диссертации, изложены четко и хорошо иллюстрированы, в основном, таблицами, графиками кривых плавления ДНК и фотографиями гистологических препаратов. Обсуждение результатов удачно совмещено с собственными экспериментальными данными (Раздел «Результаты и обсуждение») и дает подробный анализ положения данных, полученных С.Н.Абышева внутри сложившихся к настоящему времени в науке представлений. Светлана Николаевна выявила у двух пациенток мутацию в гене синдрома Блюма BLM Q548X, ранее описанную у пациентов с синдромом Блюма (не евреев Ашкенази). Причем обе носительницы мутации Q548X также являются носительницами известного полиморфизма в том же гене BLM P707S (rs146077918). При обнаружении этой мутации у пациентов с несемейными формами рака молочной железы образцы ДНК всех обнаруженных носителей мутации Q548X также содержали полиморфизм P707S (rs146077918), что может говорить о тесном сцеплении данных вариантов, хотя полиморфизм BLM P707S не транслируется, так как эта позиция находится дальше, чем обнаруженная С.Н.Абышевой мутация. Высокая частота обнаружения данной мутации (1.1%) обнаруженная в исследовании С.Н.Абышевой, позволяет предположить наличие «эффекта основателя» в славянской популяции. Присутствие «эффекта основателя» имеет важное прикладное значение для генетического тестирования наследственных мутаций, позволяя работать в первую очередь с наиболее частыми мутациями. Интересно, что одна из пациенток является носительницей как мутации BLM Q548X, так и мутации BRCА1 5382insC, причем экспрессия базальных маркеров указывает в данном случае на ключевую роль в развитии опухоли гена BRCA1. Принципиальными представляются два момента – важность своевременного выявления генного дефекта, которое позволит предотвратить летальный исход от онкологического заболевания. Кроме того, при установлении наследственного характера заболевания может заметно измениться тактика лечения пациентки, в частности, объем операции и/или характер назначаемой терапии. Работа Светланы Николаевны обосновывает целесообразность тестирования данной мутации в России в связи с присутствием «эффекта основателя» в славянской популяции. Важно, что анализ на наличие данной мутации уже включен в список тестируемых позиций для пациенток с клиническими признаками наследственного рака молочной железы в лаборатории молекулярной онкологии НИИ онкологии им. Н.Н.Петрова. Диссертационная магистерская работа С.Н.Абышевой является самостоятельным законченным научным исследованием. Выводы четко сформулированы и обоснованы полученными результатами. Указанные небольшие недостатки (например, отсутствие названия табл. 17) ни в коей мере не умаляют того положительного впечатления, которое производит магистерская диссертация Светланы Николаевны. Ее работа, выполненная с применением самых современных методов, вносит серьезный вклад в наши представления о генах, вовлеченных в развитие рака молочной железы в популяции РФ. Диссертационная магистерская работа С.Н.Абышевой, безусловно, заслуживает оценки «ОТЛИЧНО», а ее автор - искомого звания магистра биологии.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017