АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Сулима Антон Сергеевич

Квалификационная работа магистра: "Поиски генетического детерминанта специфичности взаимодействия гороха посевного (Pisum sativum L.) с клубеньковой бактерией Rhizobium leguminosarum bv. Viciae"

Аннотация: В ходе длительной совместной эволюции растения и микроорганизмы приобрели способность к установлению взаимовыгодных симбиотических отношений. Вступая в симбиоз, микроорганизмы снабжают растение необходимыми минеральными веществами и обеспечивают защиту от патогенов, растение же в свою очередь предоставляет микроорганизмам продукты фотосинтеза. Одним из наиболее изученных и представляющих несомненный интерес для человека симбиозов растений с микроорганизмами является взаимодействие представителей семейства бобовых (Fabaceae) и бактерий-азотфиксаторов из группы ризобий (рода Rhizobium, Sinorhizobium, Azorhizobium, Bradyrhizobium, Mesorhizobium). Данный симбиоз характеризуется высокой специфичностью: известно, что определённые виды растений могут вступать во взаимодействие лишь с определёнными видами бактерий. При этом некоторые генетические линии гороха посевного (Pisum sativum L.), происходящие из Афганистана, проявляют повышенную избирательность к микросимбинту, взамодействуя лишь с теми штаммами Rhizobium leguminosarum bv. viciae, которые продуцируют сигнальную молекулу (Nod-фактор) с особой модификацией. За этот признак у растений отвечает определённая аллель гена, обозначаемого Sym2. Несмотря на то, что данный ген был выявлен более 30 лет назад, его последовательность до сих пор не известна. В работе осуществлялся анализ генов-кандидатов на роль Sym2 - Sym37 и его гомолога K1. Оба гена кодируют Lys-M домен-содержащие рецепторные киназы, для которых показана возможность взаимодействия с Nod-фактором. Проводилось секвенирование данных генов у генетических линий гороха, проявляющих и не проявляющих повышенную специфичность симбиоза («афганский» и «европейский» фенотип, соответственно). В результате было продемонстрированно отсутствие в нуклеотидных последовательностях и соответствующих им аминокислотных последовательностях гипотетических белков замен, уникальных для «афганского» и «европейского» фенотипов. Был обнаружен новый ген-кандидат, названный LykX. Данный ген также кодирует рецепторную киназу и расположен в том же регионе генома гороха, что и Sym2. В результате анализа его нуклеотидной последовательности у нескольких «афганских» и «европейских» линий были выявлены замены, уникальные для линий с определённой степенью специфичности симбиоза. Таким образом, ген LykX является наиболее вероятным кандидатом на роль детерминанта специфичности взаимодействия гороха посевного с микросимбионтом Rhizobium leguminosarum bv. viciae.

Направление: Биология

Кафедра: Микробиологии

Научный руководитель: Жуков В. А. , кандидат биологических наук

Дата защиты: 18-06-2012

Отзыв о магистранте: Сулима Антон Сергеевич начал выполнять научно-исследовательскую работу в лаборатории генетики растительно-микробных взаимодействий ВНИИ сельскохозяйственной микробиологии с 2009 года, будучи студентом третьего курса биолого-почвенного факультета Санкт-Петербургского Государственного Университета. С первых дней работы в лаборатории А.С. Сулима проявил себя как увлеченный и ответственный работник, успешно справляющийся с поставленными задачами. Областью научных интересов Антона Сергеевича является изучение симбиозов, образуемых клубеньковыми бактериями с растениями семейства Бобовые. Дипломная работа А.С. Сулимы посвящена исследованию механизмов, обеспечивающих специфичное взаимодействие штаммов Rhizobium leguminosarum bv. viciae с различными разновидностями гороха посевного. В результате выполненной работы были получены ценные данные, обогащающие научные представления о контроле специфичности взаимодействия ризобий с бобовыми растениями. В частности, была выявлена последовательность гена, являющегося наиболее вероятным кандидатом на роль детерминанта специфичности взаимодействия гороха посевного с некоторыми штаммами клубеньковых бактерий. В процессе выполнения исследования Сулима А.С. приобрел навыки работы с микробиологическим и растительным материалом, освоил современные методы микробиологии и молекулярной биологии, в том числе методы работы с компьютерными базами данных и анализа нуклеотидных и белковых последовательностей. Результаты научного исследования Сулимы А.С., в том числе представленные в магистерской диссертации, были доложены на международных и российских научных конференциях. Сулима А.С. принимает активное участие в национальных и международных научно-исследовательских программах, в том числе в научно-исследовательских проектах, поддержанных Российским фондом фундаментальных исследований и Федеральным агентством по науке и инновациям. Антон Сергеевич выполняет общественную работу в лаборатории и поддерживает хорошие отношения с ее коллективом. Таким образм, Сулима А.С. является высококвалифицированным, увлеченным и ответственным молодым специалистом, работающим на современном научном уровне.

Рецензент: Осипова М. А., кандидат биологических наук

Рецензия: Проблема специфичности бобово-ризобиального симбиоза, которой посвящена диссертационная работа Сулимы Антона Сергеевича, является одним из наиболее активно изучаемым аспектом взаимодействия растений с симбиотическими микроорганизмами. За годы исследований в этой области был сделан ряд важных открытий, в частности, выявлены сигнальные молекулы, Nod-факторы, выделяемые почвенными бактериями ризобиями, определяющие специфичность взаимодействия с бобовыми растениями, а у бобовых растений были обнаружены рецепторы, способные узнавать такие молекулы. Для гороха был описан очень интересный феномен, не известный для других бобовых растений: были обнаружены линии гороха, демонстрирующие особенно узкую специфичность взаимодействия со штаммами ризобий, продуцирующими Nod-факторы строго определенной структуры. Этот феномен был описан еще в 70-годах прошлого века и получил название «афганского» фенотипа. Было показано, что «афганские» линии гороха способны вступать в симбиоз только со штаммами ризобий, несущими ген nodX, которые ответственен за определенную модификацию Nod-фактора. Несмотря на активное изучение в данной области, ген гороха Sym2, аллельное состояние которого, как было показано, определяет «афганский» фенотип у гороха, так и не был клонирован. На решение этой проблемы направлено диссертационное исследование А.С. Сулимы, посвященное поиску генов-кандидатов на роль симбиотического гена Sym2 у гороха, контролирующего узкую специфичность взаимодействия гороха посевного с клубеньковыми бактериями. Работа Антона Сергеевича состоит из следующих разделов: Введение, Обзор литературы, озаглавленный автором «Биология развития азотфиксирующего симбиоза», Материалы и методы, Результаты и обсуждение, Заключение, Выводы и Список использованной литературы. Общий объем диссертации составляет 69 страниц. К недостатку оформления работы следует отнести отсутствие Содержания, которое значительно бы облегчило работу с текстом диссертации. Во Введении обоснована актуальность исследования, сформулированы цели и задачи работы. Этот раздел демонстрирует широту взглядов автора и его умение представить изучаемую проблему с точки зрения общебиологических закономерностей. Единственное замечание к этому разделу касается формулировки цели исследования. По мнению рецензента, представленная формулировка является несколько «зауженной», соответствует, скорее группе задач работы, и не отражает всего объема работы, проделанной автором. Обзор литературы написан хорошим языком, в нем достаточно полно представлены современные представления о процессе развития бобово-ризобиального симбиоза и о его регуляции со стороны микросимбионта и со стороны растения. Особое внимание уделено контролю специфичности симбиоза у линий «афганского» гороха, обусловленной наличием аллели Sym2A. По мнению рецензента, эту часть Обзора литературы украсила бы схема, иллюстрирующая структуру, многообразие и взаимное соответствие рецепторных киназ с Lys-M доменами, выявленных у различных представителей бобовых растений. Кроме того, небольшим недочетом является наличие повторов в изложении литературных данных, встречающихся в разных подразделах Обзора литературы. При прочтении этого раздела у рецензента возникли следующие вопросы: Каково может быть биологическое значение такого «сверхспецичного» взаимодействия со строго определенным штаммом ризобий, характерного для «афганских» линий гороха? Проверялась ли ранее с помощью комплементационного анализа аллельность локуса Sym2 генам гороха Sym37 и Sym10, кодирующим рецепторы Nod-факторов? Раздел Материалы и методы написан подробно, четко и вопросов не вызывает. При прочтении раздела Результаты и обсуждение становится ясным, что автором проведена очень большая и кропотливая работа. Антон Сергеевич обнаружил новые линии гороха, проявляющие схожий «афганский» фенотип, и кроме того, провел трудоемкий гибридологический анализ этих линий гороха. Кроме того, автором были определены и проанализированы последовательности фрагментов генов Sym37 и К1, а также нового выявленного гена LykX у линий гороха с «афганским» фенотипом, что составляет в общей сложности более 35 протяженных последовательностей. В ходе выполнения работы А.С. Сулима сумел получить очень интересные данные: ему удалось выявить новый неизвестный ранее ген гороха, кодирующий рецепторную киназу, названный им LykX. Идентификация нового гена из целого семейства схожих по последовательностям генов, который отличается по последовательности от ранее известных генов Sym37 и K1 гороха, уже сама по себе является большим достижением автора. Но более того, автору удалось установить связь между аллельным состоянием ранее вновь идентифицированного гена LykX с проявлением «афганского» фенотипа у гороха. Это открытие, несомненно, является большой удачей автора и вносит значительный вклад в изучение контроля специфичности бобово-ризобиального симбиоза. В целом, корректность и достоверность результатов, полученных автором, сомнений не вызывает. Где это необходимо, полученные данные обработаны с помощью соответствующих статистических методов. Автор с осторожностью обсуждает полученные им данные. В связи с этим, хотелось бы узнать, какие эксперименты, по мнению автора, необходимо провести дополнительно, чтобы окончательно определить, соответствует ли идентифицированный ген LykX локусу Sym2 гороха посевного, и доказать, что именно ген LykX определяет специфичность взаимодействия «афганских» линий гороха с ризобиями? Сделанные в заключении работы выводы сформулированы корректно, полностью согласуются с поставленными ранее задачами и отражают полученные в ходе выполнения магистерской диссертации данные. Высказанные замечания никоим образом не снижают научную ценность представленной магистерской диссертации. В целом, диссертационная работа оформлена аккуратно, практически не содержит опечаток. Работа выполнена на высоком методическом уровне и, что нечасто встречается в выпускных квалификационных работах, содержит новые приоритетные данные. По мнению рецензента, диссертационную работу Антона Сергеевича Сулимы, несомненно, следует оценить на «отлично».

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017