АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Головина Александра Сергеевна

Квалификационная работа магистра: "Идентификация мутаций в гене рецептора липопротеинов низкой плотности у пациентов с семейной гиперхолестеринемией из числа жителей Карелии"

Аннотация: Предметом нашего исследования послужило часто встречающееся (1:500) аутосомно-доминантное заболевание - семейная гиперхолестеринемия (СГ). В этом заболевании вычленяют тип А, обусловленный сниженной скоростью удаления липопротеинов низкой плотности (ЛНП) из кровотока вследствие количественного дефицита или нарушения функции рецептора ЛНП из-за мутаций в одноименном гене. СГ типа B вызвана мутациями в гене APOB, приводящими к снижению аффинности связывания ЛНП с рецептором. Цель работы сформулирована как поиск мутаций в гене рецептора ЛНП и в гене APOB у жителей Карелии (преимущественно г. Петрозаводска) с клиническим диагнозом СГ. Для поиска мутаций использовали автоматизированный флуоресцентный SSCP-анализ (анализ конформационного полиморфизма однонитевых фрагментов ДНК), выполненный на секвенаторе “ALF Express-2” (“Amersham Biosciences”) с последующим секвенированием отобранных образцов. В результате в коллекции ДНК от 80 пробандов с СГ мутация R3500Q в гене APOB, являющаяся единственной часто встречающейся мутацией при СГ типа B в Европе, обнаружена среди жителей г.Петрозаводска не была. В гене рецептора ЛНП у жителей г. Петрозаводска обнаружено 5 видов мутаций, 4 из которых ранее не были описаны в мире. Среди этих новых мутаций: трансверсия c.618T>G (AGT>AGG; S185R или, по новой номенклатуре S206R) в 3’ части четвертого экзона гена, гетерозиготная инсерция одного нуклеотида c.195_196insT (FsV45:D108X или, по новой номенклатуре, FsV66:D129X) в третьем экзоне гена, и сложная перестройка c.192del10/ins8 (Fs S44:D108X или, по современной номенклатуре Fs S65:D129X) также в третьем экзоне гена рецептора ЛНП. В 3’концевой части гена идентифицирована выявлена лишь одна гетерозиготная делеция в пятнадцатом экзоне, обозначенная как c.2191delG (Fs V710:V715X или по современной номенклатуре FsV731:V736X). Три из четырех обнаруженных новых мутаций приводят к сдвигу рамки считывания и преждевременной терминации трансляции и, как предсказывает анализ последовательности, к образованию рецептора без трансмембранного домена, неспособного связывать и интернализовать лиганд. Мы ожидали обнаружить с высокой частотой в Карелии мутацию FH North Karelia (FsE287:V348X, c.925-931del7, альтернативное название по современной номенклатуре FsE308:V369X) мажорную в Финляндии в целом и преобладающую на востоке этой страны на границе с русской Карелией. Однако вариант FH North Karelia был найден с одинаковой низкой частотой (1:80) среди больных СГ как в Карельской популяции, так и среди жителей Санкт-Петербурга. Наследование обнаруженных мутаций в гене рецептора ЛНП, где возможно, было прослежено в семьях и показано что эти генетические нарушения сегрегируют вместе с гиперхолестеринемией. Полученные данные указывают на большое разнообразие мутаций гена рецептора ЛНП в русской Карелии и отсутствие выраженного эффекта основателя. Настоящее исследование было проведено при поддержке гранта РФФИ № 10-04-00563а.

Направление: Биология

Кафедра: Биохимии

Научный руководитель: Мандельштам М. Ю. , доктор биологических наук

Дата защиты: 18-06-2012

Отзыв о магистранте: Головина Александра Сергеевна, студентка кафедры биохимии СПбГУ, пришла в Отдел молекулярной генетики ФГБУ “Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины” СЗО РАМН в 2008 году. С 2009 года она работает на ставке лаборанта-исследователя в этом же отделе. В 2010 году А.С. Головина защитила бакалаврскую работу, посвященную изучению молекулярных основ семейной гиперхолестеринемии в Карелии. За последние два года А.С. Головина, продолжая исследование семейной гиперхолестеринемии, качественно углубила свои работы, увеличив более, чем втрое число пациентов и выявив не один, а пять видов молекулярных дефектов в гене рецептора липопротеинов низкой плотности у жителей города Петрозаводска. Она является ключевым исполнителем грантовой темы РФФИ № 10-04-00563а. Для выполнения работы магистра дипломантка освоила обширный набор методов из современного арсенала молекулярной генетики, включая методики выделения ДНК и РНК, электрофоретического анализа нуклеиновых кислот в геле, полимеразной цепной реакции, клонирования и секвенирования ДНК и другие. Большая часть магистерской работы А.С. Головиной выполнена на автоматическом секвенаторе ДНК “ALFExpress-2” (“Amersham Biosciences”) обращение с которым требует специальных навыков, которыми А.С. Головина овладела в совершенстве. Кроме того, А.С. Головина широко использует в своей магистерской работе компьютерные программы “Fragment analyzer”, “GeneRunner”, “Primer Express”, “Blast” и другие. Из студента, владеющего одной основной методикой, какой А.С. Головина была при защите выпускной квалификационной работы бакалавра, она превратилась в разностороннего специалиста, настоящего исследователя генома человека. Результаты работы А.С. Головиной отражены в четырех тезисах конференций в 2011 году и такого же количества в 2012 году. С ее участием в качестве соавтора подготовлены и отправлены две статьи: в журнал “Бюллетень экспериментальной биологии и медицины” и в журнал “Кардиология”. В настоящее время готовится еще одна статья для отправки в журнал “Генетика” (Москва). А.С. Головина докладывала свои результаты на 4-ой международной конференции для молодых ученых в Киеве (Украина) 14-17 сентября 2011 года. Как научный руководитель я чрезвычайно доволен работой Александры Сергеевны Головиной. Дипломантку отличает присутствие глубокого интереса к изучаемой области, она задает много вопросов, умеет работать в коллективе. Сегодня А.С. Головина представляет собой начитанного и умелого начинающего научного работника. А.С. Головиной рекомендуется продолжить научные исследования или в аспирантуре, или в качестве соискателя ученой степени кандидата биологических наук в области медицинской генетики. При работе над дипломом А.С. Головина проявила многие положительные черты, характеризующие ее как зрелого научного работника, а именно: терпение, усидчивость, аккуратное ведение протоколов исследование, умение брать инициативу в свои руки. Считаю, что за отношение к выполняемой работе А.С. Головина заслуживает за магистерскую диссертацию оценки “отлично”.

Рецензент: Тищенко Л. И., кандидат биологических наук

Рецензия: Представленная магистерская диссертация Александры Головиной посвящена исследованию экзонов гена рецептора липопротеинов низкой плотности (ЛПН) у больных семейной гиперхолистеринемией (СГ) из города Петрозаводска и определению спектра мутаций, вызывающих это заболевание в данной популяции. Знание спектра мутаций в каждой этнической группе необходимо для эффективной ДНК-диагностики СГ, генетического консультирования в семьях больных и назначения адекватного лечения. Именно ДНК-диагностика СГ является наиболее ранним и вместе с тем чувствительным методом, прогнозирующим это заболевание. Таким образом, актуальность исследования очевидна. Работа изложена на 59 страницах и содержит все необходимые разделы. Я прокомментирую разделы диссертации в последовательности, в которой они представлены. В разделе "Введение" обоснована актуальность выбранной темы, четко сформулированы цель и задачи исследования. В обзоре литературы дана исчерпывающая характеристика аутосомно-доминантного заболевания - СГ, подробно описаны молекулярные основы возникновения этого заболевания: они связаны чаще всего с разнообразными мутациями в гене рецептора ЛПН - их около 1000 во всем мире; и значительно реже - с мутациями в гене аполипопротеина B-100 (АРОВ), который является физиологическим лигандом рецептора ЛПН. Приводятся также данные о вкладе различных мутаций в развитие СГ и их распространение в различных регионах мира, в том числе и в России. Мне было очень интересно узнать, что 55% длины гена рецептора ЛПН составляют Alu-последовательности. Автор ограничивается только констатацией этого феномена. Следует отметить, что представленность Alu-повторов в геноме человека составляет около 11% суммарной ДНК. И поэтому напрашивается предположение, что вариации в последовательности гена рецептора ЛПН разных людей, мутации в нем, приводящие к сердечно-сосудистой паталогии, могут быть связаны с разным распределением Alu-повторов в этом гене, которые, как было указано выше, составляют 55% его длины. Вместе с тем Alu-последовательности богаты CpG-сайтами, которые могут быть метилированы в разной степени. В настоящее время появляется все больше данных о том, что изменение паттерна метилирования ДНК может быть связано с рядом наследственных и комплексных заболеваний. Все методы, необходимые для выполнения экспериментальной части работы, представляют собой современные подходы для анализа ДНК и обнаружения в ней мутаций: ЭФ в ПАА- и агарозном гелях, SSCP- и ПДРФ- анализ, ПЦР в различных модификациях, в том числе мультиплексная ПЦР в формате аллель-специфической ПЦР, секвенирование ДНК и компьютерный анализ последовательностей. К сожалению, автор в разделе "Материалы и методы" не описал принципы аллель-специфической и мультиплексной ПЦР; не указано, каким методом осуществлялось секвенирование ДНК. Все использованные методы воплощены в результатах исследования. Получен большой массив данных, которые представлены на 19 рисунках и в 4 таблицах. Очень кратко обозначу самые интересные, на мой взгляд, результаты, полученные автором. В гене АРОВ у больных СГ - жителей Петрозаводска - не обнаружена специфическая мутация, характерная для жителей средней Европы, например, Швейцарии, Австрии, Германии. Другой очень интересный факт, установленный автором, состоит в том, что популяция города Петрозаводска является гетерогенной в отношении мутаций, вызывающих СГ, с одной стороны, а с другой, - эта популяция уникальна в отношении четырех из пяти охарактеризованных мутаций, то есть обнаружены четыре новые, не известные ранее в мире мутации, вызывающие СГ. Ну и, наконец, если формализовать вышесказанное, то оно сводится к следующему: название работы соответствует ее содержанию, цель и задачи исследования четко сформулированы, использованные методы адекватны поставленным задачам, выводы соответствуют полученным результатам и поставленным задачам. Несмотря на некоторые недочеты, представленная магистерская диссертация, безусловно актуальна, выполнена на высоком теоретическом и методическом уровне с использованием современных молекулярно-биологических методов, соответствует всем предъявляемым требованиям к магистерским диссертациям и заслуживает оценки "отлично".

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017