АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Богачева Мария Сергеевна

Квалификационная работа магистра: "Исследование модульных пептидных носителей, как средств адресной доставки ДНК в клетки, содержащие рецептор CXCR4"

Аннотация: Генная терапия - это лечение наследственных и приобретенных заболеваний с помощью введения в клетку нуклеиновых кислот или их производных с целью исправления генных дефектов или направленного воздействия на процессы реализации генетической информации. Перспективным направлением является разработка невирусных способов доставки нуклеиновых кислот, в частности создание синтетических носителей на основе пептидов. Целью данной работы является исследование пептидных носителей, модифицированных сигналом ядерной локализации и лигандом рецептора CXCR4, как средств адресной доставки ДНК. Для исследования были разработаны и синтезированы аргинин-богатый цистеин-содержащий носитель и его аналоги, модифицированные сигналом ядерной локализации большого Т-антигена вируса SV40 и лигандом рецептора CXCR4. Были изучены физико-химические свойства пептидных носителей и определены оптимальные зарядовые соотношения ДНК/носитель для экспериментов по трансфекции клеточных культур. Также были исследованы токсические свойства носителей in vitro. Трансфекционная активность комплексов ДНК/носитель была изучена в экспериментах по трансфекции трех клеточных культур, различающихся содержанием рецептора CXCR4 на поверхности, а так же мезенхимных стволовых клеток. Показано, что присоединение лиганда рецептора CXCR4, либо сигнала ядерной локализации вируса SV40, увеличивает ДНК-связывающую способность и ДНК-защитные свойства пептидных носителей. Включение молекул лиганда в состав носителей с лигандом увеличивает чувствительность нуклеопептидных комплексов к гликозамингликанам. Комплексы исследованных носителей и ДНК не токсичны для клеток А172 и HeLa. Комплексы носителей с лигандом и ДНК способны трансфецировать мезенхимные стволовые клетки и избирательно трансфецировать клетки, на поверхности которых представлен рецептор CXCR4. Комплексы носителей NL1, NL2, NL3, NL5 и ДНК способны трансфецировать клетки после блокировки клеточного цикла.

Направление: Биология

Кафедра: Генетики и Селекции

Научный руководитель: с.н.с., к.б.н. Киселев Антон Вячеславович

Дата защиты: 6-06-2013

Отзыв о магистранте: Богачева Мария Сергеевна начала работу в лаборатории пренатальной диагностики наследственных болезней ФГБУ «НИИАГ им. Д.О. Отта» СЗО РАМН с 2009 года, будучи студенткой 2-го курса биолого-почвенного факультета СПбГУ. Она сразу же активно включилась в работу группы генной терапии, занимающейся исследованием новых невирусных средств доставки ДНК в клетку. Мария освоила комплекс методов тестирования невирусных носителей, включающий в себя различные физико-химические методы оценки ДНК-связывающих и ДНК-защитных свойств носителей, методы трансфекции вторичных и первичных культур клеток in vitro, а также методы выявления экспрессии маркерного гена (бета-галактозидазы и GFP). С использованием освоенных методических приемов Марией была выполнена выпускная квалификационная работа магистра, посвященная изучению модульных пептидных носителей, как средств адресной доставки ДНК в клетки, содержащие хемокиновый рецептор CXCR4. На настоящий момент Мария Сергеевна является участником нескольких проектов, посвященных разработке невирусных носителей для направленной доставки нуклеиновых кислот и генной терапии эндометриоза, поддержанных грантами РФФИ (№10-04-01236а, №12-04-31400 мол_а), ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» (№8142), Фондом Содействия МПНТС (№11025р/20250). Мария Сергеевна является со-автором статьи в журнале «Медицинская генетика», посвященной пептидным средствам доставки генетических конструкций, и заявки на изобретение (№2012158198 от 21.12.12). В экспериментальной работе Мария Сергеевна проявила аккуратность, ответственность, внимание к методическим тонкостям, умение использовать и сравнивать различные подходы к проблеме ряда авторов. Она обладает хорошим набором качеств, которые позволяют ей успешно заниматься научной работой. Хорошее знание английского языка позволило Марии широко использовать обширную литературу по молекулярной биологии, что дало возможность написать подробный литературный обзор. Во взаимоотношениях с коллективом лаборатории Мария проявила себя вежливым, деликатным и доброжелательным человеком.

Рецензент: Трухина А.В. , кандидат биологических наук

Рецензия: Магистерская диссертация Марии Сергеевны посвящена изучению физико-химических свойств пептидных носителей, которые предполагается в дальнейшем использовать для генной терапии определенных наследственных заболеваний. Актуальность темы диссертации очевидна в связи с необходимостью всестороннего изучения новых биопрепаратов перед их практическим применением. Особое внимание в работе уделяется невирусным пептидным носителям, содержащим лиганд рецептора CXCR4, сигнал ядерной локализации, а также новому модульному носителю, в состав которого входят обе дополнительные последовательности. Магистерская диссертация Марии Сергеевны представлена на 88 страницах печатного текста и содержит традиционные разделы: список сокращений, введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты, обсуждение, выводы, список литературы. Последний включает 163 источника, 8 из которых на русском языке. Большая часть (95) статей из списка литературы опубликована в течение последних 10-ти лет. Во «Введении» (3 стр.) автор знакомит читателя с актуальностью выбранного направления генной терапии. В этой части магистерской диссертации Мария Сергеевна обосновывает выбор объекта исследования, четко формулирует цель и очерчивает круг задач, которые необходимо выполнить для ее решения. Раздел «Обзор литературы» написан довольно подробно и является достаточно объемной частью работы (18 стр.). Сначала автор рассматривает имеющиеся в литературе данные о генной терапии, ее основных направлениях и проблемах. Далее им описываются основные системы доставки генетических конструкций, их преимущества и недостатки. Отдельно рассматривается роль сигнала ядерной локализации в доставке таких конструкций. Этот раздел работы не оставляет сомнений в том, что автор хорошо разбирается в представленном материале. Глава «Материалы и методы» (9 стр.) написана достаточно подробно. Использование каждого метода вполне оправдано для выполнения поставленных задач. Однако ее можно сократить, удалив «вынужденные» повторения, которые допускает автор, описывая методы. Кроме того, в этом разделе хорошо было бы описание составов сред и буферов вынести в раздел «Приложение». Есть и другие замечания. Так, например, в тексте о материале исследования не указывается носитель NL5, но он встречается в таблице 1. Не везде приводится страна-изготовитель реактивов и оборудования, а если и приводится, то почему-то чаще на английском языке. В разделе «Результаты» (26 стр.) автор приводит результаты своего исследования по каждому типу пептидного носителя. В этом разделе представлены многочисленные таблицы (15), графики (5), диаграммы (14), электрофореграммы (6), иллюстрирующие полученные результаты. Последние четко сформулированы и соответствуют тому, что продемонстрировано иллюстративным материалом. Подписи к рисункам и таблицам достаточно подробны и понятны. Тем не менее, по мнению рецензента, качество данного раздела можно значительно улучшить, если вынести большинство таблиц в раздел «Приложение». Это касается именно тех таблиц, которые проиллюстрированы диаграммами и даже имеют ту же подпись. В разделе «Обсуждение» (11 стр.) автор анализирует полученные результаты и сопоставляет их с данными, опубликованными ранее другими учеными. Обсуждение полностью соответствует полученным результатам Однако к этой и другим частям работы у рецензента возникло несколько замечаний и соответственно вопросов: 1) При изучении токсичности комплексов ДНК с носителями автор оценивал выживаемость клеток после трансфекции. В некоторых случаях была получена выживаемость более ста процентов, но автор никак не обсуждает это. 2) В большинстве экспериментов изучаются комплексы ДНК/носитель с зарядовым соотношением 1/4, но в качестве контроля используются комплексы ДНК/ПЭИ с зарядовым соотношением 1/8. Чем автор может объяснить это несоответствие и почему нельзя было использовать комплексы с одинаковым зарядовым соотношением? В заключение необходимо отметить, что работа в целом производит хорошее впечатление. Автором были освоены и использованы многочисленные методы и проделана кропотливая работа по изучению свойств пептидных носителей. Полученные автором результаты могут служить основой для рекомендаций при работе с ними. Работа аккуратно оформлена, хотя и есть некоторый уровень опечаток. Но все мелкие замечания не влияют на качество выполненной работы, которая соответствует всем требованиям, предъявляемым к магистерским диссертациям в Санкт–Петербургском Государственном Университете. Поставленные задачи выполнены, сделаны соответствующие выводы, поэтому работа, безусловно, заслуживает оценки «отлично».

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017