АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Попова Дарья Александровна

Квалификационная работа магистра: "Транскрипционная активность субтеломерного тандемного повтора ДНК в малигнизированных и соматических клетках домашней курицы (Gallus gallus domesticus)"

Аннотация: Транскрипты, синтезируемые на тандемно повторяющихся последовательностях ДНК, задействованы во многих фундаментальных клеточных процессах, таких как сборка кинетохоров, ко-транскрипционный сайленсинг генов и формирование гетерохроматина. Сравнительное изучение феномена транскрипции некодирующей белки тандемно повторяющейся ДНК позволит получить новые данные в области функционирования и организации геномов эукариот. В работе рассматривается транскрипция тандемных повторов ДНК в нормальных соматических и малигнизированных клетках птиц отряда Galliformes (Курообразные). В качестве объекта исследования выбрана домашняя курица (Gallus gallus domesticus). Описанные в геноме курицы тандемные повторы локализованы в районах гетерохроматина. Несмотря на их расположение, блоки некодирующих белки тандемных повторов ДНК могут транскрибироваться в половых клетках самок. Вместе с тем, на сегодняшний день транскрипция тандемных повторов ДНК в соматических клетках представителей класса Птицы, в том числе домашней курицы, не изучена. В работе впервые показана транскрипция консервативного субтеломерного тандемного повтора PO41 в клетках лимфобластомы курицы линии MDCC-MSB1 и в тканях различных органов курицы с помощью метода флуоресцентной in situ ДНК/РНК-гибридизации. Для повтора РО41 характерна универсальная картина распределения и морфология фокусов транскриптов как в клетках линии, так и в клетках тканей. Получены приоритетные данные о распределении транскриптов повтора PO41 на разных стадиях клеточного цикла. Результаты исследования показали, что в начале стадии анафазы происходит выстраивание транскриптов повтора РО41 в виде крупных зернистых доменов в экваториальной части клетки, которые на стадии поздней анафазы претерпевают распределение по дочерним клеткам; в телофазе кластеры транскриптов окружают терминальные участки конденсированных хромосом. Методами FISH и иммунофлуоресцентного окрашивания установлено, что в малигнизированных клетках субтеломерный повтор PO41 транскрибируется с участием РНК-полимеразы II. Специфичной колокализации основного домена интерфазных ядер, содержащего транскрипты повтора РО41, c кластерами интерхроматиновых гранул или тельцами Кахала не обнаружено. Полученные данные расширяют представление о роли транскриптов тандемных повторов в функционировании геномов позвоночных.

Направление: Биология

Кафедра: Цитологии и Гистологии

Научный руководитель: доцент, к.б.н., А.В. Красикова

Дата защиты: 8-06-2013

Отзыв о магистранте: Попова Дарья Александровна, магистрант 2-го года обучения, пришла в лабораторию структуры и функции хромосом кафедры цитологии и гистологии биолого-почвенного факультета СПбГУ осенью 2011 года. Дарья Александровна пришла к нам с базовой подготовкой в другой области, поскольку квалификационную работу бакалавра на тему «Молекулярно-генетическая детекция цианобактерий из группы прохлорофитов в водоемах Северо-Западного региона РФ» она защитила на кафедре микробиологии биолого-почвенного факультета СПбГУ. В нашей группе Дарья быстро переключилась на новую тему работы, связанную с изучением феномена транскрипции некодирующей белки тандемно повторяющейся ДНК у эукариот. Одновременно Дарья начала работать инженером-исследователем кафедры цитологии и гистологии биолого-почвенного факультета СПбГУ. За время работы в лаборатории Дарья освоила широкий спектр методов клеточной биологии, включая полимеразную цепную реакцию (ПЦР), иммунофлуоресцентное окрашивание, флуоресцентную in situ гибридизацию (FISH), двумерную флуоресцентную и фазово-контрастную микроскопию, конфокальную лазерную сканирующую микроскопию и методы обработки трехмерных изображений. Дарья Александровна также проявила большую активность в углубленном освоении необходимых современных методик и, пройдя конкурсный отбор, успешно окончила Всероссийскую научную школу для молодёжи «Современные методы флуоресцентной визуализации в биомедицинских и биотехнологических исследованиях» (г. Москва, ИБР РАН, 17-22 сентября 2012 г.) и Зимнюю научную школу «Современная биология & Биотехнологии будущего» (г. Пущино, 26 января-3 февраля 2013 г.). Успешное сочетание освоенных методов позволили Дарье Александровне получить ряд принципиально новых научных результатов, включая данные о транскрипции с участием РНК-полимеразы II обеих нитей консервативного субтеломерного тандемного повтора PO41 в клетках лимфобластомы курицы (G. g. domesticus) линии MDCC-MSB1 и в тканях различных органов курицы, распределении транскриптов повтора PO41 на разных стадиях клеточного цикла. Результаты исследований были представлены ею в виде устного доклада на Научно-практической конференции с международным участием «XLI Неделя науки СПбГПУ» (г. Санкт-Петербург, 3–8 декабря 2012 г.) и вошли в ряд других публикаций в сборниках трудов конференций. Д.А. Попова принимает активное участие в научно-исследовательской работе группы по гранту РФФИ (№ 12-04-01807-а), Мероприятию 2 СПбГУ (2011-2013 г.г.) и другим проектам. Со своим проектом на тему «Транскрипция субтеломерных и прицентромерных сателлитных повторов ДНК в соматических клетках птиц отряда Galliformes» Дарья Александровна стала победителем конкурса грантов 2012 года для студентов вузов, расположенных на территории Санкт-Петербурга. Дарья Александровна зарекомендовала себя как увлеченный, работоспособный и инициативный молодой исследователь. Дарья самостоятельно планировала необходимые для реализации дипломного проекта эксперименты. Хочется особенно отметить способность Дарьи Александровны самостоятельно анализировать полученные данные. Она может квалифицированно представлять результаты проделанной научно-исследовательской работы. Я считаю, что работа Дарьи Александровны в процессе подготовки магистерской диссертации заслуживает оценки отлично, а сама Дарья Александровна имеет большой потенциал для научного роста.

Рецензент: к.б.н. Енукашвили Н.И.

Рецензия: Выпускная квалификационная работа Поповой Дарьи Александровны посвящена актуальной теме исследования транскрипции субтеломерного тандемного повтора ДНК в малигнизированных и соматических клетках домашней курицы. Актуальность темы обусловлена тем, что транскрипция некодирующей ДНК является одной из горячих точек современной клеточной биологии и биологии вообще. Исследование транскрипции некодирующих ДНК и, в частности, ДНК тандемных повторов стало одной из важных вех в современной биологии, поскольку работы в этой области привели к пересмотру т.н. «центральной догмы клеточной биологии» - обобщающее наблюдаемое в природе правило реализации генетической информации: информация передаётся от нуклеиновых кислот к белку. Одним из открытий начала 21 века стало обнаружение того факта, что таким образом работает не более пяти процентов генома. А считавшаяся транскрипционно инертной ДНК тандемных повторов, как оказалось, транскрибируется довольно интенсивно в определенных ситуациях. При этом данные транскрипты не кодируют каких-либо белков. Однако в данном направлении исследований еще много неизвестного. Исследования, большей частью, носят описательный характер, поскольку еще только необходимо понять, когда и в каких случаях активируется транскрипция тандемных повторов. Считается, что в этом, возможно лежит ключ к пониманию роли таких транскриптов в клетке. При этом основное внимание уделяется изучению транскрипции тандемных повторов, локализованных в центромерных и прицентромерных участках хромосом, субтеломерные же повторы пока остаются в тени. Распределение же субтеломерных повторов повторов в различных (в том числе соматических) тканях домашней курицы (Gallus gallus domesticus) никем ранее не исследовалось. Так же не изучено цикл-зависимое распределение транскриптов тандемных повторов. Поэтому работа Дарьи Александровны, безусловно, представляет большой интерес. Работа выполнена по традиционному плану и состоит из разделов: «Введение», «Обзор литературы», «Материалы и методики», «Результаты», «Обсуждение». Список литературы содержит ссылки на 116 литературных источников. В ходе выполнения проекта Поповой Дарьей Александровной впервые показана транскрипция консервативного субтеломерного тандемного повтора PO41 в клетках лимфобластомы курицы MDCC-MSB1 и в тканях различных органов курицы. Автором получены данные о как характере распределения в разных тканях, так и о реорганизации исследуемых транскриптов в ходе клеточного цикла. Результаты исследования показали, что в интерфазе транскрипты могут быть распределены либо в виде 1-2 гранул, либо диффузно, во время профазы образуются мелкие гранулы транскрипта, в начале анафазы происходит выстраивание транскриптов повтора PO41 в экваториальной части клетки, которые в поздней анафазе распределяются по будущим дочерним клеткам, а в телофазе окружают терминальные участки хромосом. Таким образом, транскрипты в клетках курицы выявляются на протяжении всего клеточного цикла, и их пространственная локализация претерпевает значительные изменения. Кроме этого автором показано тканеспецифичное распределение транскрипта тандемного повтора PO41. Полученные данные, безусловно, обогащают наше представление о транскрипции некодирующих последовательностей. В работе использованы современные методы и подходы, полностью соответствующие поставленным задачам. Из работы видно, что автор прекрасно владеет методами конфокальной микроскопии, что позволяет ей получать изображения прекрасного качества. Отдельно хотелось бы отметить качество оформления работы. Редко встречаются студенты с таким прекрасным владением языком и чувством стиля, знанием правил орфографии и пунктуации. Несмотря на то, что в целом, выпускная квалификационная работа выполнена на высоком уровне, написана очень хорошим, грамотным языком, а автор показала, несомненно, прекрасное знание литературы по тематике ВКР, в работе присутствуют отдельные недочеты. Так, с моей точки зрения, в обзоре литературы автор местами избыточно цитирует обзоры вместо оригинальных статей, что, возможно, связано со стремлением минимизировать и без того внушительный список литературы. На стр. 46 автор пишет: «Важно подчеркнуть, что транскрипты повтора PO41 выявляются исключительно в ядре интерфазных клеток, при этом в цитоплазме сигналов выявлено не было». Однако, при использовании только лишь методов микроскопии данное утверждение, с моей точки зрения, не совсем точно, т.к. видимость сигнала во многом зависит от зонда, настроек микроскопа, характера обработки изображений. Вопрос же о цитоплазматических и внеклеточных транскриптах тандемных повторов на сегодня является открытым. Автор характеризует положение транскриптов по отношению к гетерохроматину на основании окраски интеркалирующим красителем DAPI. Однако это не совсем корректно – гетерохроматиновые участки не всегда окрашиваются интеркалирующими красителями в интерфазном ядре. Следует также отметить, что работу, несомненно, дополнили бы данные, полученные биохимическими и молекулярно биологическими методами. И, как следует из обсуждения, подобные исследования запланированы автором в ближайшем будущем. Однако эти небольшие недочеты ни в коем случае не умаляют всех достоинств работы, которая, с моей точки зрения, полностью соответствует требованиям, предъявляемым к Выпускной Квалификационной Работе магистра и, безусловно, заслуживает оценки отлично, а Попова Дарья Александровна – присуждения степени магистра.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017