АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Покровский Даниил Кириллович

Квалификационная работа магистра: "Разработка тестерной системы для поиска генов, взаимодействующих с CHD1, у Drosophila melanogaster"

Аннотация: Хроматин — это динамичная структура, сборка и разборка которой играют важнейшую роль в жизни клетки, как с точки зрения генетического, так и эпигенетического регулирования жизненного цикла. Существует много опубликованных данных по изучению АТФ-зависимых факторов сборки хроматина in vitro. На сегодняшний день известно множество факторов, вовлечённых в сборку и ремоделирование хроматина. Например, такие как гистоны (H1, H2A, H2B, H3 и H4) и их модифицированные и вариантные формы, гистоновые шапероны (CAF-1, NAP1, HIRA и другие) и непосредственно АТФ-зависимые факторы сборки и ремоделирования хроматина (ISWI, CHD1 и многие другие). Намного меньше известно об их функциях in vivo. Сейчас стало очевидно, что АТФ-зависимые факторы сборки хроматина, участвуя в процессах реорганизации и сборки хроматина, образуют обширную сеть взаимодействий. Кроме того они способны частично компенсировать функции друг друга, тем самым затрудняя исследование in vivo. В данной работе была создана тестерная система на объекте Drosophila melanogaster для поиска новых генов, взаимодействующих с АТФ-зависимым факторам сборки и ремоделирования хроматина CHD1, in vivo. Тестерная система основана на использовании GAL4-зависимой индукции экспрессии интерферирующих РНК к гену Chd1. Проверка работоспособности системы проводилась на АТФ-зависимых факторах сборки и ремоделирования хроматина, гистоновых шаперонах, гистонах и их вариантных формах. С помощью созданной тестерной системы было проанализировано 14 генов. Для девяти из проанализированных генов было показано взаимодействие с АТФ-зависимым фактором сборки и ремоделирования хроматина Chd1.

Направление: Биология

Кафедра: Генетики и Селекции

Научный руководитель: к.б.н., с.н.с., Конев А.Ю.

Дата защиты: 14-06-2013

Отзыв о магистранте: Магистр второго курса кафедры генетики биолого-почвенного факультета Санкт-Петербургского государственного университета Покровский Даниил Кириллович выполнял в лаборатории генетики эукариот отделения молекулярной и радиационной биофизики Петербургского института ядерной физики им. Б.П. Константинова дипломную работу магистра на тему «Разработка тестерной системы для поиска генов, взаимодействующих с Chd1, у Drosophila melanogaster». В процессе работы Д.К. Покровский зарекомендовал себя как инициативный, вдумчивый и добросовестный исследователь, способный участвовать в решении сложных научных задач в области генетики, клеточной и молекулярной биологии. Д.К. Покровский освоил и успешно применяет методы, необходимые для проведения экспериментов по изучению механизмов сборки хроматина и ремоделирования хроматина in vivo на модели Drosophila Melanogaster: метод непрямой иммунофлуоресценции для локализации специфических белков на политенных хромосомах слюнных желез, синтез необходимых линий дрозофилы, цитологическое и генетическое исследование эффектов мутаций и другие. В процессе работы Д.К. Покровский изучил большой объем литературных источников, посвященных эпигенетической регуляции и ремоделированию хроматина. Он активно участвует в анализе полученных результатов и планировании дальнейшей работы. Исследование, выполняемое Д. К. Покровским является частью проекта, посвященного изучению сети генетически взаимодействующих факторов, вовлеченных в сборку хроматина. Выполненный Даниилом проект посвящен выявлению генов, взаимодействующих с геном, кодирующим фактор сборки и ремоделирования хроматина Chd1. Знания, которые мы получим в ходе реализации данного проекта должны позволить нам разработать всеобъемлющую картину взаимодействия и / или взаимного дополнения функций факторов сборки и ремоделирования хроматина в различных клеточных процессах, таких, как формирование и поддержание структуры хроматина, регуляция транскрипции и регуляция процессов развития многоклеточного организма. Исследования таких факторов должны привести к более глубокому пониманию роли сборки и ремоделирования хроматина в зпигенетической регуляции у многоклеточных организмов. Кроме того, принимая во внимание высокий уровень консерватизма факторов сборки и ремоделирования хроматина среди эукариотических организмов, предлагаемые исследования должны предоставить существенную информацию для понимания молекулярных основ заболеваний человека, связаных с возникновением отклонений в структуре хроматина и процессов метаболизма ДНК. Результаты проделанной к настоящему времени Д.К. Покровским работы были представлены на 15-ой международной шоле-конференции для молодых учёных «Биология – наука XXI века», Пущино, 18-22 апреля 2011, на конференции молодых ученых ОМБР ПИЯФ РАН, 25-26 мая 2010. Д. К. Покровскому быд присужден Диплом за лучший устный доклад на 15-ой международной шоле-конференции для молодых учёных «Биология – наука XXI века». Пущино, 18-22 апреля 2011. Он является соавтором работы опубликованной в журнале Genes&Development: Alexander V. Emelyanov, Elena Vershilova, Maria A. Ignatieva, Daniil K. Pokrovsky, Xingwu Lu1, Alexander Y. Konev, and Dmitry V. Fyodorov. Drosophila TIP5/Toutatis, ISWI and CtBP Form an ATP-Dependent Chromatin Assembly Complex ToRC», а также работы, опубликованной в журнале «Цитология», N 3, 2013. Считаю, что Д.К. Покровский безусловно достоен присуждения ему степени магистра, а его работа заслуживает оценки “отлично”.

Рецензент: Е.И. Михайлова , доктор биологических наук

Рецензия: В настоящее время большое внимание привлечено к изучению механизмов, за счет которых осуществляется сборка и ремоделирование хроматина, их связи с эпигенетической регуляцией экспрессии генов, реализацией наследственной информации и поддержанием целостности генетических систем. В этом смысле магистерская работа Покровского Даниила Кирилловича исключительно современна. Выполненная на высоком экспериментальном уровне, она посвящена поиску генов, продукты которых, взаимодействуют с АТФ-зависимым фактором сборки и ремоделирования хроматина Chd1 у Drosophila melanogaster и направлена на создание тестерной системы для таких исследований. Магистрантом показано, что особи, одновременно гомозиготные по мутантным аллелям генов СHD1 и Iswi, летальны на эмбриональной стадии развития, что не позволило детально изучить взаимодействие этих факторов, используя политенные хромосомы. Автором была создана тестерная система, изучена экспрессия интерферирующих РНК в клетках имагинальных дисков крыла. Этот подход позволил установить, что 9 генов, из 14 изученных, взаимодействуют с CHD1. Рецензируемая работа состоит из традиционных разделов и написана с привлечением большого количества современных научных статей. Введение логично подводит к формулировке целей и задач, однако ссылка на «Определение «взаимодействия генов» в данной работе» не убеждает, так как в тексте диссертации наблюдается путаница в обозначениях как генов так и белков, гены взаимодейтсвут с белками, хотя взаимодействий ДНК-белок изучать в данной работе не подразумевалось, и так далее. Обзор литературы охватывает широкий круг вопросов, связанных с изучаемой проблемой, начиная с определения того, что такое хроматин и нуклеосомы, на какие типы хроматин подразделяют и с какими функциональными особенностями это связано, для каких фундаментальных процессов необходима сборка и/или ремоделирование структуры хроматина. Даниил Кириллович подробно рассматривает роль семейств АТФ-зависимых хроматин-ремоделирующих белков, которые изменяют ДНК-гистоновые контакты и тем самым модифицируют структуру хроматина. Автор также останавливается на посттрансляционных модификации гистонов и связанных с этим эпигенетических изменениях, которые определяют так называемый «гистоновый код», рассмотрена гипотеза гистонового кода. Д.К. Покровский также приводит основные характеристики группы белков, названных «гистоновыми шаперонами» и анализирует их структурные особенности и механизмы действия. Раздел «Материал и методы» написан лаконично, но дает хорошее представление об основных этапах экспериментальной работы. Несколько странной выглядит вводный абзац этого раздела, названный «Работа с Drosophila melanogaster» и состоящий только из двух строк. «Полученные результаты и обсуждение» написаны детально. Собственные данные соотнесены с информацией из других источников и этот раздел вызывает несомненный интерес. Выводы соответствуют поставленным задачам, однако формулировку их нельзя считать удачной. Работа иллюстрирована 14 рисунками, а также снабжена хорошими табличками. Однако следует отметить, что некоторые рисунки, в особенности фотографии политенных хромосом могли быть и покрупнее. Размер таблиц не всегда соответствует размеру страниц (например табл. 5 выходит за пределы печатного текста). Список литературы насыщенный, насчитывает 149 наименований, из них на русском языке 6 статей, в одной из которых магистрант является соавтором. Впечатление от работы Даниила Кирилловича несколько портит наличие опечаток. В целом же работа производит очень благоприятное впечатление. Творческое выполение ее Д.К. Покровским несомненно. Высказанные замечания не умаляют значимости достижений студента, его способности обсуждать результаты и осваивать новые современные методы. Работа соответствует требованиям, предъявляемым к квалификационным работам магистра и заслуживает отличной оценки.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017