АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Игнатьева Мария Александровна

Квалификационная работа магистра: "Создание модели для поиска факторов, вовлеченных в сборку хроматина у Drosophila melanogaster."

Аннотация: Данная работа направлена на нахождение и изучение факторов, вовлеченных в процессы сборки и разборки хроматина. Для этого была создана и протестирована генетическая система, позволяющая находить новые факторы, вовлеченные в преобразования хроматина, с помощью проведения и анализа скрещиваний линий Drosophila melanogaster. Основой данной системы является анализ фенотипических проявлений, вызванных встраиванием закодированного трансгенной конструкцией укороченного гистона, называемого H3.3-core, в хроматин. В H3.3-core удалены аминокислоты 4-36 в N-конце, модификация которых существенна для различных процессов эпигенетической регуляции. Встраивание в хроматин гистонов, которые нельзя модифицировать, может приводить к нарушению этих регуляторных процессов. Данные нарушения имели видимые фенотипические проявления при экспрессии H3.3-core под GAL-4 драйвером, имевшим проявление только в крыле. В скрещиваниях использовались линии, несущие мутации генов и RNAi-конструкции, позволяющие подавлять действие генов. Если исследуемый ген оказывался вовлеченным в сборку хроматина, то это приводило к изменению количества встроенных H3.3-core гистонов, и, следовательно, к измененному фенотипическому проявлению, которое обнаруживалось в рамках данной системы. В качестве модельного фактора, вовлеченного в процесс сборки хроматина, был изучен фактор CHD1 D. melanogaster. Выводы данной работы: 1.CHD1 вовлечен в независимую от репликации сборку хроматина на политенных хромосомах личинок Drosophila melanogaster. 2. Модель, основанная на экспрессии укороченного гистона H3.3-core, пригодна для поиска новых факторов, вовлеченных в сборку хроматина у Drosophila melanogaster.

Направление: Биология

Кафедра: Генетики и Селекции

Научный руководитель: к.б.н. Конев А.Ю

Дата защиты: 14-06-2013

Отзыв о магистранте: Магистр второго курса кафедры генетики биолого-почвенного факультета Санкт-Петербургского государственного университета Университета Игнатьева Мария Александровна выполняла в Лаборатории Генетики Эукариот Отделения Молекулярной и Радиационной Биофизики Петербургского Института Ядерной Физики им. Б.П. Константинова магистерскую работу на тему «Создание модели для поиска факторов, вовлеченных в сборку хроматина у Drosophila melanogaster». Мария начала работу в моей группе Эпигенетики в около четырех с половиной лет назад, когда она была студенткой второго курса Санкт-Петербургского государственного университета. Она с самого начала поразила меня как очень хорошо мотивированный и самостоятельный человек, желающий участвовать в научных исследованиях. Исследования, проводимые М. Игнатьевой, являются частью проекта, посвященного изучению сети взаимодействующих факторов, участвующих в сборке и ремоделировании хроматина у дрозофилы. Эти факторы являются эволюционно высоко консервативными, что позволяет использовать полученные в ходе наших исследований знания для понимания соответствующих процессов у человека. Изучение факторов сборки и ремоделирования хроматина имеет фундаментальное значение для понимания процессов эпигенетической регуляции у многоклеточных организмов. Исследование эпигенетических механизмов является одной из наиболее перспективных и быстро развивающихся областей современной биологии. М. Игнатьева проявила себя как активный, вдумчивый и добросовестный молодой исследователь, способный к самостоятельному решению сложных научных проблем в области генетики, клеточной и молекулярной биологии. Она принимает самое активное участие не только в получении научных результатов, но и в их интерпретации и самостоятельном планировании дальнейшей работы. В процессе работы ею было выявлено, что гиперэкспрессия как нативной, так и доминант-негативной форм CHD1 приводит к образованию очень сильно деконденсированного хроматина, либо, возможно, к нарушению структуры хроматина в сайтах связывания белка CHD1. Этот ее результат является очень важным для дальнейшего развития наших исследований и позволяет нам создать модель для изучения роли связанной с транскрипцией сборки хроматина в регуляции активности генов, формировании структуры хроматина и в развитии многоклеточных организмов. Она является соавтором работы опубликованной в журнале Genes&Development: Alexander V. Emelyanov, Elena Vershilova, Maria A. Ignatieva, Daniil K. Pokrovsky, Xingwu Lu1, Alexander Y. Konev, and Dmitry V. Fyodorov. Drosophila TIP5/Toutatis, ISWI and CtBP Form an ATP-Dependent Chromatin Assembly Complex ToRC», а также работы, опубликованной в журнале «Цитология», N 3, 2013. Считаю, что М.А. Игнатьева безусловно достойна присуждения ей степени магистра, а ее работа заслуживает оценки “отлично”.

Рецензент: Смирнов А.Ф. , доктор биологических наук

Рецензия: Целью рецензируемой работы явилось создание модели пригодной для поиска факторов, вовлеченных в сборку хроматина у дрозофилы. Конкретными задачами явилось исследование CHD1 как модельного фактора, участвующего в независимой от репликации сборке хроматина в политенных хромосомах дрозофила и опробование модели для поиска новых факторов вовлеченных в такую сборку, основанную на экспрессии гистона H3.3-core в клетках крыла. Тему работы следует признать. безусловно, актуальной в теоретичеком и практическом плане как завязанную на структурные основы эукариотических хромосом и важные эпигенетические процессы. Диссертация написана по традиационному плану и содержит общепринятые разделы : “Обзор литературы” (11стр.),“Материалы и методы” ( 7 стр. ), “Результаты” ( 9 стр. ), “Обсуждение “( 6 стр. ),” Выводы” ( 1 стр.- два вывода, комплементарные задачам), “Список Литературы” ( 5 стр., 43 наименования, все англоязычные ). Часть “ Материалы и Методы” cодержит описание процедуры иммунофлуоресцентного окрашивания политенных хромосом, получения микрофотографий, перечень используемых линий Dr. melanogaster, включая экспрессирующие H.3.3.-core GFP, гиперэкспрессирующие различные формы белка CHD1 под контролем GAL4 (GAL4 – драйвера. Приведены данные по скрещиванию. Дан список линий, несущих мутации по генам вовлеченным в сборку илиремоделирование хроматина или несущие РНКi конструкции , позволяющие инактивировать гены, вовлеченные в сборку хроматина. В части 4.1 раздела ”Результаты “ приведы данные по участию фактора СHD1 в процессе сборки хроматина, включая изменения структуры политенных хромосом, встраивание в них гистона Н3.3-сore- GFP. Часть 4.2. посвящена использованию модели, основанной на экспрессии укороченного гистона H.3.3-core- GFP, поиску новых факторов вовлеченных в сборку хроматина. В ней последовательно описываются фенотипические проявления встраивания гистона H3.3-core в хроматин., установление модифицируумости фенотипа, обусловленного встраиванием Н3.3- core гистонов и проверке работоспособности системы для поиска нрвых факторов, включенных в сборку хроматина. В “Обсуждении” последовательно рассмотрена роль СHD1 как фактора сборки хроматина и значение модели, основанной на экспрессии укороченного гистона Н3.3-core- GFP, включая оценку ее чувствительности и в частности к факторам репликативной и пострепликативноц сборки хроматина, способам подавления работы генов, участвующих в сборке хроматина. Работа заканчивается лишь двумя выводами практически соответствующим поставленным задачам магистерской диссертации. В ней сформулировано пожелания на проведение в дальнейшем полноразмерного скрининга и приведены его основные параметры. Анализируя квалификационную работу в целом стоит отметить четкость и краткость изложения материала. Аккуратность оформления текста. Методический уровень работы достаточно высок, результаты интересны и адекватно интерпретированы. В качестве недостатка следует отметить излишнюю краткость, конспективность работы, что особенно проявилось в литературном обзоре. Так подраздел “ Cтруктура хроматина” занимает полстраиицы и практически сводится к самому общему описанию нуклеосом , без всякого упоминания других уровней. Говоря о комплексах ремоделирования как главном компоненте сборки хроматина по сути упоминается только один из вариантов SW1/SNF комплекса- CHD1, на исследовании которого практически и строится работа. Но ведь известны еще по крайней мере три- комплекса- ISW1, Mi-2, Ino-8. Какова их роль в сборке хроматина? Чрезмерно кратко изложены данные о коллекция РНКi .О их специфике приходится лишь догадываться ,мсхлдя из абриатуры- Iswi, Hira и т.д. Работа может и должна иметь продолжение, некоторые направлеиия которого указаны автором и ее можно оценить на “ ОТЛИЧНО.”

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017