АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Кобзева Анастасия Андреевна

Квалификационная работа магистра: "Идентификация штамма х-51 “Rhizophydium” (Chytridiomycetes)"

Аннотация: Chytridiomycota – одноклеточные организмы, принадлежащие, по современным данным, к монофилетическому таксону Holomycota в группе Opisthokonta. Их изучение непосредственно связано c реконструкцией общего предка и проблемами ранних этапов эволюции опистоконтов. Систематика Chytridiomycota традиционно основывалась на морфологических признаках таллома. Однако с развитием методов электронной микроскопии система хитридиомицетов подверглась серьезному пересмотру. Показано, что для идентификации светооптические признаки недостаточны. Сейчас систематика хитридиомицетов опирается на ультраструктуру зооспор и данные молекулярной филогении. В данной работе представлен молекулярно-филогенетический и ультраструктурный анализ штамма x-51 CALU (коллекции водорослей Ленинградского университета), паразита желто-зеленой водоросли Tribonema gayanum Pacher CALU 20, который был отнесен по признакам морфологии спорангия к роду Rhizophydium Schenk, одному из наиболее крупных и морфологически гетерогенных родов. Были секвенированы последовательности 18S и 28S рРНК, а также проведен сравнительно-ультраструктурный анализ зооспор штамма x-51 и других хитридиомицетов. На основании филогенетического древа, построенного по генам большой и малой субъединиц рибосомы, можно утверждать, что изучаемый штамм образует отдельную ветвь, не принадлежит роду Rhizophydium и не является близким родственником порядка Rhizophydiales. Его обособленное положение подтверждается ультраструктурой. Зооспоры штамма x-51 демонстрируют уникальные для хитридиомицетов ультраструктурные характеристики. Таким образом, синтез молекулярно-генетических и ультраструктурных данных даёт основание полагать, что этот штамм принадлежит к новому крупному таксону ранга порядка.

Направление: Биология

Кафедра: Зоологии Беспозвоночных

Научный руководитель: д.б.н. Карпов Сергей Алексеевич

Дата защиты: 14-06-2013

Отзыв о магистранте: А.А. Кобзева обучалась на кафедре зоологии беспозвоночных с 3-го курса бакалавриата, и все это время занималась научной работой. Сначала она осваивала методы культивирования протистов, световой и электронной микроскопии на разных объектах, а в магистратуре обучилась методам молекулярно-филогенетических исследований. Работу по молекулярной филогении хитридиомицета (штамм х-51) она выполнила в группе В.В.Алешина (Ин-т им. Белозерского, МГУ), где стажировалась дважды по месяцу. За все время обучения и научных занятий в ней проявилась склонность к теоретическим знаниям, которая позволяла ей иметь самостоятельный взгляд на те или иные устоявшиеся научные догмы. В практической работе аккуратна, без чего невозможно успешно работать с хитридиомицетами указанными методами. Такое редкое сочетание способностей могло бы дать гораздо более ощутимые результаты при лучшей организации труда. Надеюсь, в будущем Настя продолжит научную работу, которой сможет уделять больше времени и внимания, чем это было до сих пор. Хочется пожелать ей успехов в этом интересном деле.

Рецензент: д.б.н. Ю.К. Новожилов

Рецензия: В настоящее время происходят стремительный пересмотр макросистем грибов и протистов на основе молекулярно-генетических данных, а также ультраструктурной морфологии клеток. Одной из ключевых групп в современной системе грибов являются хитридиомицеты, которые также активно изучаются протистологами. Следует подчеркнуть, что несмотря на успешное использование ультраструктурных признаков в систематике хитридиомицетов, в последнее время макросистема этой группы продолжает испытывать значительные изменения. Во многом это связано с переходом от морфологической концепции вида к филогенетической, основанной на молекулярно-генетических маркерах. Кроме того, чрезвычайная вариабельность морфологических признаков хитридиомицетов, а также сложность культивирования (особенно паразитических форм) создают дополнительные препятствия при построении их системы, а также интерпретации результатов исследований. В последнее время особые надежды возлагаются на альянс молекулярно-генетические методов с традиционными ультраструктурными исследованиями морфологии жгутикового аппарата зооспор. Предлагаемая к защите работа лежит в русле этих направлений и посвящена малоизученным и сложным вопросам систематики и филогении хитридиевых грибов. Актуальность и новизна исследования не вызывает никакого сомнения. В задачи автора входило, выяснить положение на филогенетическом дереве одного из штаммов хитридиомицета Х-51 «Rhizophydium», предварительно отнесенного по морфологическим характеристикам к Rhizophydium mammillatum (Braun) Fisher. Решение задачи предполагалось провести на основании полученных сиквенсов молекулярных маркеров (18S и 28S рДНК), а также сопоставления полученных результатов с ультраструктурными признаками зооспор. В связи с этим несомненна актуальность проделанной автором работы по сопоставлению и анализу ультраструктурных признаков зооспор, полученных его коллегами, с оригинальными результатами молекулярно-генетического анализа генов 18S и 28S рДНК. Работа является законченным экспериментальным исследованием в сочетании с обширным литературным обзором по рассматриваемой проблеме. Работа полностью соответствует уровню магистерской диссертации. Диссертация изложена на 47 страницах и состоит из введения, 4 глав, выводов и списка цитируемой литературы. Текст иллюстрирован 17 рисунками и фотографиями высокого качества. Первая глава изложена на 28 страницах и включает разносторонний обзор научной литературы по рассматриваемой проблеме. В главе приводятся данные об истории изучения рода Rhizophydium, его морфологии, таксономии и биологии. В главе также подробно дается характеристика хитридиомицетов в целом, включая морфологию, географию, жизненные циклы и характеристику паразитических видов. Особое внимание уделяется филогении и ультраструктурной организации зооспор. Заканчивается глава оригинальным и подробным морфологическим описанием изученного штамма, а также сравнением с наиболее близким морфологически видом Rhizophydium mammillatum. Подчеркивается, что поскольку изученный штамм Х-51 не имеет выступающей папиллы на спорангии, его нельзя отнести по морфологическим признакам к R. mammillatum. Закономерно возникает вопрос о месте штамма в системе хитридиомицетов. Глава написана ясно, с приведением самых последних данных, в контексте цели и задач работы. Приводится история макросистематики хитридиевых, а также системы, принятые в различных работах. Здесь также рассматриваются вопросы, которые традиционно являются дискуссионными. Для них даются различные точки зрения. Во второй главе, изложенной на 2 страницах, подробно описана техника культивирования, а также молекулярно-генетические методы и методы филогенетического анализа и реконструкции деревьев. Методы описаны достаточно подробно и полностью соответствуют поставленным в работе задачам. Третья глава, посвящена результатам работы, в ней дается филогенетическое древо 18S+28S, построенное на основании байесовского анализа (BS) и метода максимального правдоподобия (ML) с указанием положения изучаемого вида в филогении хитридиомицетов. Важно подчеркнуть, что это основной результат работы. В главе Обсуждение автор обобщает полученные результаты и сравнивает их с уже имеющимися литературными данными, что показывает его умение хорошо работать с научной литературой и анализировать научную информацию. Полнота обсуждения рассматриваемой проблемы полностью соответствует полученным результатам. В этой главе дается важный вывод о том, что некоторое сходство штамма X-51 с Rhizophydium mammillatum не подтверждается ни ультраструктурным анализом зооспор ни результатами молекулярно-генетического анализа гена 18S рДНК. Полученные автором результаты показывают, что изученный штамм занимает обособленное положение на древе хитридиомицетов. Раздел Выводы является обобщением результатов всей работы и отражает основные положения диссертации. Выводы полностью соответствуют поставленным целям и задачам и отражают результаты работы. Замечания. Имеются лишь небольшие замечания по тексту, а также в отношении рисунков. 1. Хотелось бы чтобы автор унифицировал название штамма в тексте работы, как это дано в заглавии. В тексте встречается три варианта: x-51, X-51, х-51 CALU. 2. На стр. 4 сказано, что штамм был определен морфологически как Rhizophydium mammillatum (Braun) Fisher, но не ясно почему этот вид несколькими строчками ниже приводится как Rhizophydium sp. Только после прочтения результатов становится все на свои места. 3. На рисунок 2 в тексте ссылки нет. 4. После рисунка 10 произошел сбой цитирования рисунков в тексте, так как Рисунок 10 с филогенетическим деревом должен иметь номер 11 и т.д. 5. Материалы и методы как и другие разделы не обозначены как главы. Несмотря на эти незначительные замечания работа выполнена на очень высоком квалификационном уровне и заслуживает оценки ОТЛИЧНО (5).

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017