АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Колобов Алексей Александрович

Квалификационная работа магистра: "Изучение регуляции транскрипции гена AGXT2 мыши"

Аннотация: В настоящее время остро стоит проблема поиска подходов к фармакологической коррекции концентрации асимметричного диметиларгинина(ADMA) плазмы крови. Одним из ферментов, способных метаболизироватьADMAinvivoявляется аланин-глиоксилатаминотрансфераза 2 (AGXT2). В данной работе впервые предпринята попытка изучения регуляции транскрипции гена AGXT2 мыши. С целью предсказания структуры предполагаемой регуляторной области гена AGXT2 мыши проведен анализ еёконсервативности и анализ данных проекта ENCODE на базе UCSCgenomebrowser. Выявлен район предполагаемого корового промотора. С целью оценки значения различных участков предполагаемой регуляторной областигенаAGXT2 мыши создана серия рекомбинантных плазмид на базе вектора pGL4.10, несущих эти участки, контролирующие репортерный ген люциферазы. Данными плазмидамипроведенатрансфекция клеточной линии гепатоцитов мыши. Об активности экспрессии гена люциферазы судили по её ферментативной активности в лизатахтрансфицированных клеток. В результате получены данные о структуре предполагаемой регуляторной области гена AGXT2 мыши, локализован коровый промотор и предполагаемые регуляторные элементы.

Направление: Биология

Кафедра: Биохимии

Научный руководитель: м.н.с. Демьянов Антон Викторович

Дата защиты: 18-06-2013

Отзыв о магистранте: С большим удовольствием предоставляю вам краткую характеристику на Колобова Алексея Александровича. Я знаком с Колобовым А.А. с 2009 года, когда он начал работать в лаборатории молекулярной вирусологии ГосНИИ ОЧБ под руководством Круковской Ларисы Леонидовны. В данной лаборатории он занимался генетическими опухолеспецифичными маркерами у человека и защитил бакалаврскую диссертацию. В октябре 2011 года Алексей перешел в лабораторию иммунофармакологии Гос. НИИ ОЧБ, где начал работать над магистерской диссертацией на тему «Изучение регуляции транскрипции гена AGXT2 мыши» под моим руководством. Включившись в работу нашей группы, Алексей проявил себя как самостоятельный и очень энергичный работник. Алексей проявил способности к обстоятельному анализу научной литературы и быстро овладел новыми для него методиками, необходимыми в работе. Энтузиазм, организованность, ответственность и беспримерная трудоспособность Алексея, проявленные им в работе, позволили ему быстро достичь поставленных целей. Особо хочется отметить человеческие качества Алексея. Он всегда дружелюбен с коллегами, добр и готов помочь. Он отлично вошёл в новый для него коллектив и стал важной его частью.

Рецензент: Г. И.Чихиржина , кандидат биологических наук

Рецензия: Работа А.А. Колобова заслуживает внимания, в первую очередь, потому что она является основательным исследованием, посвященным изучению фундаментальный проблемы молекулярной биологии – регуляции генной активности на разных уровнях организации генома. В этой области ведутся интенсивные, исследования достигнут значительный прогресс. Однако фундаментальные вопросы такие, как формирование и реализация тканеспецифичной программы транскрипции, роль транскрипционных факторов, разных классов малых РНК, белковых комплексов, ремоделирующих структуру хроматина, в регуляции эпигенетически наследуемых хроматиновых локусов и индивидуальных генов остаются открытыми и являются привлекательными для многих научных коллективов. Магистерская диссертация посвящена изучению регуляции транскрипции гена аланин-глиоксилат аминотрансферазы 2 (AGXT2), фермента участвующего в метаболизме так называемого ассиметричного диметиларгинина. По мнению автора представленное исследование является одним из первых в изучении регуляции транскрипции этого гена. Продукты гена AGXT2 участвуют в метаболизме патологичесих факторов, связанных с сердечно-сосудистыми заболеваниями. В связи с этим работа А.А. Колобова представляет большой интерес в прикладном аспекте, так как полученные результаты могут быть использованы при разработке подходов в коррекции уровня патологических факторов в крови при диагностике и лечении сердечно-сосудистых заболеваний. На основании вышеизложенного магистерская диссертация выполнена на актуальную тему и направлена на решение фундаментальных проблем молекулярной биологии. Основной целью работы являлось изучение организации промоторной области гена AGXT2 и выявление отдельных транскрипционных факторов, участвующих в регуляции транскрипции этого гена. В задачи исследования входило изучение организации структуры промотора и возможных регуляторных факторов транскрипции гена методами компьютерного анализа; создание серии рекомбинантных плазмид для изучения роли различных областей 5 –области гена в регуляции его активности; изучение возможной роли транскрипционного фактора HNF4a на транскрипцию гена. Для решения поставленных задач автором были использованы молекулярно-биологические и генетические подходы. Выбранные автором методы являются современными и адекватными задачам работы: это направленный мутагенез, получение генетических конструкций, секвенированиеДНК, различные варианты ПЦР, компьютерный анализ. Ознакомление с методической частью работы дает глубокое удовлетворение, так как методы хорошо опробированы и используются профессионально. А.А. Колобов успешно справился с поставленными задачами, получил новые данные об организации регуляторной области гена аланин-глиоксилат аминотрансферазы 2 и регуляции его транскрипции. Выводы сделаны на основании большого экспериментального материала, хорошо аргументированы и отражают сущность представленной работы. Магистерская диссертация А.А. Колобова представлена по традиционному плану на 62 страницах, включает 21 рисунок, 3 таблицы и приложение. Результаты экспериментальной работы представлены на 13 рис., в 3-ех таблицах и в виде приложений к результатам секвенирования ДНК. Список литературы содержит 174 цитированных источника, среди них только одна работа отечественного автора (Томилин Н.), опубликованная в зарубежном журнале, 13 работ, опубликованных в 2010-2012 г.г. Введение и обзор литературы изложены на 30 страницах, в них отражены сведения, необходимые для оценки состояния проблемы исследования. В разделе «Материалы и методы исследования» (15 страниц) детально описываются все методические подходы. В разделе «Результаты и обсуждение» (14 страниц) логично и в понятной форме изложены результаты работы, а также проведено сопоставление собственных результатов с теми, которые имеются в литературе. Диссертация написана хорошим языком, изложена логично, присутствует четкая взаимосвязь названия работы, цели, задач и выводов. При рассмотрении работы А.А. Колобова возникают отдельные вопросы дискуссионного характера. Известно, что в регуляции генов участвуют многочисленные транскрипционные факторы. Так в регуляции транскрипции ряда тканеспецифичных генов печени также участвуют транскрипционные факторы семейства FoxA1 совместно с фактором HNF4A. В связи с этим, можно ожидать, что, в действительности, существуют многочисленные факторы регуляции транскрипции изучаемого гена, которые можно выявить при использовании других методов тестирования. Остается открытым вопрос о реальном участии в регуляции транскрипции гена аланин-глиоксилат аминотрансферазы 2 транскрипционного факора HNF4a (объекта исследования представленной работы) in vivo. Для решения этого вопроса представляются необходимыми исследования по иммуноосаждению хроматина с последующим анализом ДНК методом ПЦР в режиме реального времени. Справедливым будет отметить, что автор работы при ее обсуждении также поднимает эти вопросы. Замечания по оформлению работы немногочисленны. Основное из них касается подписи к рисунку 17: необходимо указать метод, которым получены и обработаны результаты. В работе иногда встречаются неудачные выражения: «молекулы клеточной адгезии» (стр. 32), «человеческий ген» (стр.27), трансактивационная функция (стр. 31). Список литературы составлен грамотно. На основании вышесказанного магистерская диссертация А.А. Колобова «Изучение регуляции транскрипции гена AGXT2 мыши» заслуживает отличной оценки.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017