Биологический факультет СПбГУ |
Генетика микроорганизмов |
Академик РАН, проф. С.Г. Инге-Вечтомов
Проф. А.П. Галкин
Проф. Г.А. Журавлева
Проф. М.В. Падкина
Проф. Е.В. Самбук
Проф. А.А. Нижников
Доц. С.Е. Москаленко
Ст. преп. Т.М. Рогоза
Асс. Е.И. Степченкова
Асс. О.В. Тарасов
С.н.с. С.П. Задорский
Доц. С.А. Бондарев – заведующий специализацией "Генетика микроорганизмов"
Н.с. А.А. Рубель
Н.с. А.Г. Матвеенко
Н.с. М.В. Белоусов
М.н.с. О.М. Землянко
Н.с. А.М. Румянцев
Основные направления исследований Тематика работ специализации не ограничена исследованиями микроорганизмов, а охватывает широкий круг проблем. К кафедре генетики и биотехнологии относятся лаборатории физиологической генетики и биохимической генетики. Многие исследования осуществляются на базе других лабораторий СПбГУ и организаций-партнеров: ИОГен РАН и ВНИИСХМ:
Зав. лабораторией - проф. С.Г. Инге-Вечтомов Терминация трансляции и механизмы её регуляции. Взаимодействие шаперонов с прионами и амилоидами. Структура амилоидных и прионных агрегатов. Поиск новых амилоидов человека и описание взаимодействий между ними.
Зав. лабораторией - проф. М.В. Падкина Изучение координированной регуляции экспрессии генов (модельные объекты – дрожжи Saccharomyces cerevisiae и Pichia pastoris). Биотехнология микроорганизмов – синтез различных рекомбинантных белков с использованием дрожжей-продуцентов. Исследование новых сорбентов нуклеиновых кислот. Синтез наноструктур из РНК и изучение их свойств.
Зав. лабораторией – проф. Ю.О. Чернов Поиск амилоидогенных белков человека и предсказание способности белка формировать амилоиды. Изучение изменений в белках, которые влияют на возникновение амилоидов. Выявление факторов среды и физиологических факторов, влияющих на возникновение амилоидов. Разработка новых подходов к профилактике и терапии амилоидных болезней, основанных на понимании механизма амилоидогенеза.
Зав. лабораторией - проф. А.П. Галкин Идентификация функциональных амилоидов у высших и низших эукариот. Анализ взаимодействия прионов и амилоидов. Выявление амилоидов, ассоциированных с закономерной возрастной нейродегенерацией головного мозга человека.
Зав. лабораторией – к.б.н. Е.И. Степченкова Динамика превращения первичных повреждений генетического материала и его наследуемые изменения. Молекулярные механизмы патологических мутационных взрывов в геноме эукариот. Механизмы, регулирующие участие ДНК-полимераз в процессе становления мутаций в клетках эукариот. Роль ферментов метаболизма пуринов в поддержании стабильности генома.
Зав. лабораторией – д.б.н. А.А. Нижников Изучение молекулярных механизмов вирулентности и патогенеза бактерий. Разработка алгоритмов и программ для аннотирования особенностей структуры и функций белков. Функциональная геномика, транскриптомика и протеомика прокариот. Идентификация и характеристика амилоидных и прионных белков в протеомах прокариот, дрожжей и растений. Темы ВКР 2020-2021 (в скобках - руководители)
Сотрудничество
Некоторые достижения коллектива специализации последних лет: В ходе работы специализации впервые были секвенированы геномы штаммов дрожжей Петергофской генетической коллекции U-1A-D1628 и 74-D694. На основании полученных данных были созданы полные сборки геномов этих штаммов хромосомного уровня, а также проведено детальное их сравнение с геномом эталонного штамма дрожжей S288C и осуществлен поиск структурных перестроек. Barbitoff Y.A., Matveenko A.G., Matiiv A.B., Maksiutenko E.M., Moskalenko S.E., Drozdova P.B., Polev D.E., Beliavskaia A.Y., Danilov L.G., Predeus A.V., Zhouravleva G.A. Chromosome-level genome assembly and structural variant analysis of two laboratory yeast strains from the Peterhof Genetic Collection lineage, G3: Genes, Genomes, Genetics, 2020.
Stepchenkova E.I., Shiriaeva A.A., Pavlov Y.I. Deletion of the DEF1 gene does not confer UV-immutability but frequently leads to self-diploidization in yeast Saccharomyces cerevisiae. DNA Repair. 2018. Международная группа учёных из ИНЦ РАН, СПбГУ, ВНИИСХМ РАН, Исследовательского центра клеточной биологии Монпелье (Франция) и Национального университета Ла-Платы (Аргентина) исследовала влияние аминокислотных замен на структуру модельных амилоидных фибрилл на основе белка дрожжей Sup35. Использование разнообразных физико-химических методов позволило выявить существенные различия в структуре этих агрегатов, а также показало, как амилоидспецифичный краситель тиофлавин Т, может быть успешно использован для исследования полиморфизма амилоидных фибрилл и выявления даже небольших различий в их структуре. A.I. Sulatskaya, S.A. Bondarev, M.I. Sulatsky, N.P. Trubitsina, M.V. Belousov, G.A. Zhouravleva, M.A. Llanos, A.V. Kajava, I.M. Kuznetsova, K.K. Turoverov. 2020. Point mutations affecting yeast prion propagation change the structure of its amyloid fibrils. Journal of Molecular Liquids. 2020.
Музаев Д.М., Румянцев А.М., Аль Шанаа У.Р., Самбук Е.В. Селективная система на основе фрагментов вируса М1 для отбора трансформантов дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Экологическая генетика. 2020. |
© Биологический факультет СПбГУ, 2006-2011 |