Биологический факультет СПбГУ

Дополнительные материалы к курсу «Молекулярная биология»: структуры биомолекул


Авторский курс лекций “Молекулярная биология” к.б.н. доцента Людмилы Ивановны Тищенко, каф. биохимии СПбГУ
Составление и программирование: Г. А. Пожванов, Л. И. Тищенко.

Многие особенности структуры биологических молекул, белков и нуклеиновых кислот, определяют их свойства и функции в живой клетке. В настоящее время исследованы реальные структуры десятков тысяч биологических молекул, от небольших фрагментов ДНК до сложных комплексов ДНК с белковыми транскрипционными факторами и целых субчастиц рибосом. В предлагаемых материалах специальные микропрограммы подготавливают 3D-отображение структурных моделей биомолекул, акцентируя внимание студента на наиболее важных аспектах структуры молекул, которые обсуждаются в лекционном курсе. В интерактивном режиме можно просматривать трёхмерные молекулярные модели в простой программе с русскоязычным интерфейсом, нетребовательной к ресурсам компьютера (см. системные требования).

Дополнительные материалы к курсу «Молекулярная биология» охватывают темы практически всех лекций курса, от структуры ДНК и молекулярной организации генома до белков и нуклеиновых кислот, обеспечивающих трансляцию белка на рибосомах. Особенно подробно представлены молекулярные структуры нуклеиновых кислот, ферментов и надмолекулярных комплексов, осуществляющих процессы репликации, транскрипции и биосинтеза белка. Также представлены структуры биомолекул, участвующих в регуляции этих процессов.



Базальный транскрипционный фактор TBP в комплексе с ДНК



Структура транспортной РНК на примере тРНКPhe



Структура фрагмента из двух нуклеосом



PCNA, белковый комплекс



Вид программы, управляющей списком молекулярных структур

Системные требования:
Компьютер на платформе PC с операционной системой Windows® 98, 2000, Me, XP, Vista или более новой; Процессор >800MHz;
Оперативная память 128 Mb и больше (для сложных структур, таких как модель рибосомы, 256÷512Mb); Свободное место на жёстком диске 130 Mb для установки файлов.

Литература:
H.M.Berman, J.Westbrook, Z.Feng, G.Gilliland, T.N.Bhat, H.Weissig, I.N.Shindyalov, P.E.Bourne. The Protein Data Bank // Nucleic Acids Research. 2000. V. 28. No. 1. PP. 235-242.
http://www.pdb.org/pdb/



© Биологический факультет СПбГУ, 2006-2011